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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003596`

染色体: Chr01 坐标: 54519348-54520526 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003596`
名称	SmilChr01G003596
描述	FCS-Like Zinc finger 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54519348 - 54520526 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994505`
GeneID	`130994505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994505`
原始查询	`SmilChr01G003596`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FCS-Like Zinc finger 5-like
产物	FCS-Like Zinc finger 5-like
Arabidopsis	`AT1G22160` (AT1G22160) senescence-associated family protein (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838821] identity=54; qcov=0.899; evalue=7.87e-39; confidence=medium
Rice	`Os08g0407600` - identity=41.2; qcov=1.16; evalue=8.45e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04570 (zf-FLZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775533.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775533.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775533.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775533.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775533.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54519659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:54519665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,D6
`Chr1:54519669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C25,D6
`Chr1:54519702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:54519721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C75
`Chr1:54519724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:54519726`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B138,C75
`Chr1:54519726`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B138,C75
`Chr1:54519755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B138,B69
`Chr1:54519766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C29
`Chr1:54519778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B119,B45,B5,B61,B62,B89,C11,C27,C29,C30
`Chr1:54519791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B62,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775533.1

138 aa

138

zf-FLZ

PF04570 zf-FLZ 65-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775533.1`	Pfam	`PF04570`	zf-FLZ	Domain	65	115	2.2e-25	88.6	zinc-finger of the FCS-type, C2-C2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919550.1
TGATCCATCTCAAAAATAGGAATAAAATAAAACGAATGCTGACGAGGCCTCCCCCAACAATAATGCAACCTTTCTCAAAATTCTCAATACAGAAACCAAATCAACGGCCCAGATCTCCTCCCCCGTTTCTGGCTCTCCGTTTATCTTCCCAATCTTCCCCAGCTCTTCACACTCCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCAAATAGCCTCGATTCTATGTGCATAGAAACATAAATCAAGGTAGAGAGAAGTGGAAATTGAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994505
ATGATGTTGGGAAAGAGAGCTCGCCCGCCGATGAAGAGGACTACGAGCATGACGGAGTTCACCTTGGATCTCAACGGCGGCGCTGTCTATCAGCCGTCGGATCCTCAAAATCCTTTCAACGGCGGTATAGATCAGCAGTACTTGGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCAGCTCCGAGATCGCAGCGCCGCAACTCGGCTGACTTCGTTCAAACGGCTAGTTTTTTGAGGGTTTGCTCCTTCTGCAAACGCCGTCTCGTTCCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775533.1
MMLGKRARPPMKRTTSMTEFTLDLNGGAVYQPSDPQNPFNGGIDQQYLASAAAAAAPRSQRRNSADFVQTASFLRVCSFCKRRLVPGRDIFMYRGDSAFCSLECRQQQISQDERKDKCSLTASKQEASSAAGETVPAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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