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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003602`

染色体: Chr01 坐标: 54571680-54573014 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003602`
名称	SmilChr01G003602
描述	ATP synthase delta chain, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54571680 - 54573014 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994309`
GeneID	`130994309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994309`
原始查询	`SmilChr01G003602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase delta chain, chloroplastic-like
产物	ATP synthase delta chain%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G09650` (ATPD) F-type H+-transporting ATPase subunit delta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826551] identity=53.4; qcov=0.996; evalue=6.78e-87; confidence=high
Rice	`Os02g0750100` - identity=59.2; qcov=0.395; evalue=1.34e-34; confidence=low
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009772 (photosynthetic electron transport in photosystem II); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis); GO:0045261 (GO:0045261); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00213 (OSCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057775340.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057775340.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057775340.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775340.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54572305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:54572311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:54572345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C57
`Chr1:54572464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B64
`Chr1:54572623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775340.1

248 aa

124

248

OSCP

PF00213 OSCP 66-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775340.1`	Pfam	`PF00213`	OSCP	Family	66	239	1.7e-43	149.4	ATP synthase delta (OSCP) subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919357.1
GGCAATTAGAATGGATTTTAAATTTGAATATACACTTCTTTTTGCCGTTACTAATTGCACATTCTTAAAAATGAACTTGTCTAATTCCAAACTACCAAGCTACAAAATCCTCAGCCAAACAATCTCCCGCTTGATAATATCAATAATAGTCAATCGATAGCTAATGCAAGCACCTCTTATTTAGTCATGAAATTTTTGACTCATCCAGTGCGAGACATCCACGTGTCAAATTTTTATCCCCTGCTTGAGATAAGATGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994309
ATGGCCGCCGCTCTGCAGCAGACTCCAATCACATTCCGTTCCCGCTCGCCGCCGTCGGCGCAACTCCAATCGAAACCAACAAGCAAGCTCTCCCTCTCTTCAAGTTTCAAGCTCACCAGACTGACCATCAAACCCTACCTCCGCCGCGGGGGACGTGGCGGCGCGTGCGGCGCCAGGATGGCCAACACCGCGTCGGCGAGCTACGCCAATGCGCTCGCCGACATCGCCGTCGCCAATGGCAGCCTCGCCGAGACCGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775340.1
MAAALQQTPITFRSRSPPSAQLQSKPTSKLSLSSSFKLTRLTIKPYLRRGGRGGACGARMANTASASYANALADIAVANGSLAETAADVEKLVDKFFSDEAIMSYFTNPTVRIEAKREIVDEICKSMNLQPHVANFLNILVDMKRIDLIKEIVEEFDLIVNRLSNTQVATVTSVVQLEPQHLAEIAKRVQKLTGAKNVKIKTKIDESLLAGFTIRYGDSGSKLIDMSVKKQLEEIAAQLDLGDIQLVG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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