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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003607`

染色体: Chr01 坐标: 54610428-54611414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003607`
名称	SmilChr01G003607
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54610428 - 54611414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010168`
GeneID	`131010168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010168`
原始查询	`SmilChr01G003607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=32.8; qcov=0.705; evalue=7.33e-18; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=30.7; qcov=0.802; evalue=1.19e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793573.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793573.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793573.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793573.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793573.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54610437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,B70,C41,C52,C62
`Chr1:54610497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr1:54610507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:54610508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B132,B15
`Chr1:54610582`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	B103,B113,B119,B12,B120,B125,B136,B138,B23,B38,B39,B42,B43,B45,B48,B51,B52,B54,B58,B61,B64,B71,B76,B78,B81,B90,B92,B94,C14,C17,C2,C23,C24,C4,C49,C5,C51,C55,C56,C61,C64,C66,C68,C71,C72,C77,C9,D2,D4,D8
`Chr1:54610596`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C17
`Chr1:54610596`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C17
`Chr1:54610599`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C17
`Chr1:54610599`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C17
`Chr1:54610656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	83	A11,A18,A21,A5,A9,B103,B106,B107,B111,B113,B118,B119,B12,B120,B125,B132,B136,B19,B23,B25,B27,B28,B31,B32,B33,B38,B39,B40,B42,B43,B45,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B61,B64,B71,B76,B78,B81,B89,B90,B91,B92,B94,C14,C17,C2,C22,C23,C24,C25,C29,C36,C4,C41,C42,C45,C49,C5,C51,C55,C56,C58,C61,C62,C64,C66,C68,C72,C77,C82,C86,C9,D11,D2,D3,D4,D7,D8
`Chr1:54610661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:54610663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B137,B15

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937590.1
ATGGACATGGAGCTCGGCTATCGGTTCGGAACCCGCAGCGAGAGATTTCAAAGCTTGGATGCTCTCCTTTCGTTAGCTTCTAGTTTCTCGCTTTTCCTTGTTCTTTTTCTTTCTTCCCCGGTGGTTGCTACATCTTTCTTTCTCCTGTACTCTGAACCTGGTCGTATCACTTTGATTAAAGCGGTCTTGCAAGCAATACCTATATATCAGCTCTCGTTCTCTTGTGTTCCAAAATCGGTCGTGAGAAACCTTAATTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010168
ATGGACATGGAGCTCGGCTATCGGTTCGGAACCCGCAGCGAGAGATTTCAAAGCTTGGATGCTCTCCTTTCGTTAGCTTCTAGTTTCTCGCTTTTCCTTGTTCTTTTTCTTTCTTCCCCGGTGGTTGCTACATCTTTCTTTCTCCTGTACTCTGAACCTGGTCGTATCACTTTGATTAAAGCGGTCTTGCAAGCAATACCTATATATCAGCTCTCGTTCTCTTGTGTTCCAAAATCGGTCGTGAGAAACCTTAATTCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793573.1
MDMELGYRFGTRSERFQSLDALLSLASSFSLFLVLFLSSPVVATSFFLLYSEPGRITLIKAVLQAIPIYQLSFSCVPKSVVRNLNSIFVKFLWGGGGGNSGSIAWIKWGVLCSNKSEGGLGFKNLEWFSWASVSKWIWRYLEGEEALWVRVLRSVHGDVVWGGEGGAGLGCPGVGRGWWPKILNLGGRASGGWFLQNLSRSIGNGRNTKFWGNRWLGAKPLRYVDPRLFRLCVDRDVSVEKFGNWVEGTWLWEFRWRRQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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