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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003617`

染色体: Chr01 坐标: 54702558-54706971 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003617`
名称	SmilChr01G003617
描述	uncharacterized SmilChr01G003617
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54702558 - 54706971 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993798`
GeneID	`130993798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993798`
原始查询	`SmilChr01G003617`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM-repeat/Tetratricopeptide repeat (TPR)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830884]; symbol=AT5G10200; hit=AT5G10200; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM-repeat/Tetratricopeptide repeat (TPR)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830884]; symbol=AT5G10200; hit=AT5G10200; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G10200` (AT5G10200) ARM-repeat/Tetratricopeptide repeat (TPR)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830884] identity=77.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0421300` - identity=79.6; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF26524 (ARM_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774820.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774820.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774820.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774820.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774820.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54703952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:54705417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:54705447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D2
`Chr1:54705700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774820.1

624 aa

312

624

ARM_7

PF26524 ARM_7 7-244 aa

XP_057774825.1

624 aa

312

624

ARM_7

PF26524 ARM_7 7-244 aa

XP_057774829.1

624 aa

312

624

ARM_7

PF26524 ARM_7 7-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774820.1`	Pfam	`PF26524`	ARM_7	Repeat	7	244	7.8e-117	389.6	Plant ARM repeat
`XP_057774825.1`	Pfam	`PF26524`	ARM_7	Repeat	7	244	7.8e-117	389.6	Plant ARM repeat
`XP_057774829.1`	Pfam	`PF26524`	ARM_7	Repeat	7	244	7.8e-117	389.6	Plant ARM repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918837.1
TTTTCACTGACTCTATTCACTCACACTCCCTGTCCCAACCAACAACACCCAAAAAAAGTTTCCACAAAGTAAGAATCAAATTTATCAGCTCGTAAACAAATTGCAATTTAGAAACCCAAAAGGAGGAATTTCCCACCTCCCCAGATCAACCACTCGCAAATTCTCAGGTGGTAGCTTGATGTGGACTTAGTTGCAAGTTCTGGGGAAAATAGTTAATCTTACGACGAGCATGGATAAACTAACCACCGACTGTCCATATC...

XM_057918846.1
GACTCTATTCACTCACACTCCCTGTCCCAACCAACAACACCCAAAAAAAGTTTCCACAAAGTAAGAATCAAATTTATCAGCTCGTAAACAAATTGCAATTTAGAAACCCAAAAGGAGGAATTTCCCACCTCCCCAGATCAACCACTCGCAAATTCTCAGCCTGGTAAAGCAAACTGGATGAGGAGTGGAGTCAAGTTACATGCTTGTATGATGTGAAAGCCTTGCAAACTTATAAGAAAGATTCTTCATTGGTTGATGGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993798
ATGGATAAACTAACCACCGACTGTCCATATCCTGGGTGCTTCTTCTGTGTAATGAAGGAAGGGAACCCAAGCAAGCGCAGAGCAAGTGTACTAAAATTCTTCCGGGAACTTCCTTCACAGGATGATGATAGTCAAGTTCTTCCTATCAGTGGCCTTTGGAACACAGCAATGGCACATCCTAATGATCCTGAGTTTATTGAGCTCGGAATTTTCGAATGCATGACAGCACTCATCTGGAAGGGCTTAAAGAATCGCCGTTG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057774820.1
MDKLTTDCPYPGCFFCVMKEGNPSKRRASVLKFFRELPSQDDDSQVLPISGLWNTAMAHPNDPEFIELGIFECMTALIWKGLKNRRWLSHDQNIYIPYYAAHIIGSYTMNMEEFAEMAVHAGVIPALVELLRGRLTWVEQRVAVRALGHLATYASTFPALASHGEILELSMQLAASSLEIVYTHFYQYVDRRLSYHCDLLTRGMGGVEMESRKAEEWASQLQCWSLQLINCFAFKHEFLPTICKPEFLVKLPGMWGGLVN...

XP_057774825.1
MDKLTTDCPYPGCFFCVMKEGNPSKRRASVLKFFRELPSQDDDSQVLPISGLWNTAMAHPNDPEFIELGIFECMTALIWKGLKNRRWLSHDQNIYIPYYAAHIIGSYTMNMEEFAEMAVHAGVIPALVELLRGRLTWVEQRVAVRALGHLATYASTFPALASHGEILELSMQLAASSLEIVYTHFYQYVDRRLSYHCDLLTRGMGGVEMESRKAEEWASQLQCWSLQLINCFAFKHEFLPTICKPEFLVKLPGMWGGLVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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