当前解析结果
SmilChr01G003623| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003623 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003623 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003623 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 54783278 - 54790583 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994406 |
|---|---|
| GeneID | 130994406 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994406 |
| 原始查询 | SmilChr01G003623 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994406 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775442.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775447.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057775434.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057775434.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775438.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:54785581 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr1:54787150 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 31 | A19,A22,A4,B103,B114,B118,B12,B13,B140,B33,B36,B41,B47,B8,B82,B83,C15,C17,C3,C30,C37,C40,C5,C53,C54,C59,C61,C75,C79,C84,C85 |
Chr1:54787154 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B134,C63,C87 |
Chr1:54787163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,C15 |
Chr1:54787189 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B110,B5,B78,B85 |
Chr1:54787195 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B115,B89 |
Chr1:54787205 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B119,B123,C64 |
Chr1:54787205 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B123,C64 |
Chr1:54787232 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B140,C29,C34 |
Chr1:54787237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B134,C3 |
Chr1:54787254 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B133,C29 |
Chr1:54787254 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B133,C29 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
17 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。