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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003625`

染色体: Chr01 坐标: 54802917-54805356 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003625`
名称	SmilChr01G003625
描述	uncharacterized oxidoreductase At4g09670-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54802917 - 54805356 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994113`
GeneID	`130994113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994113`
原始查询	`SmilChr01G003625`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826553]; symbol=AT4G09670; hit=AT4G09670; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826553]; symbol=AT4G09670; hit=AT4G09670; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G09670` (AT4G09670) Oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826553] identity=61.9; qcov=0.997; evalue=2.99e-177; confidence=high
Rice	`Os10g0403700` (Ord) - identity=61.2; qcov=0.992; evalue=2.69e-153; confidence=high
GO	GO:0000166 (nucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF01408 (GFO_IDH_MocA); PF22725 (GFO_IDH_MocA_C3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775135.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775135.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775135.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775135.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54803481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B85
`Chr1:54803489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B89,C39,D1
`Chr1:54803539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B85,C65,C67,C74
`Chr1:54803608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B66
`Chr1:54804729`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B131
`Chr1:54804729`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B131
`Chr1:54805051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B127,C12,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775135.1

361 aa

180

361

GFO_IDH_MocA

GFO_IDH_MocA_C3

PF01408 GFO_IDH_MocA 7-126 aa PF22725 GFO_IDH_MocA_C3 144-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775135.1`	Pfam	`PF01408`	GFO_IDH_MocA	Domain	7	126	2.2e-21	77.5	Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold
`XP_057775135.1`	Pfam	`PF22725`	GFO_IDH_MocA_C3	Domain	144	260	1.1e-11	45.5	GFO/IDH/MocA C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919152.1
TTCCCTTTTGAAGGACAGATTTTATACTCTATTTCTGATTTGTTAATAAGAAACAAAAACCCAATTCAGACAGACAGCAATGATTGGCGTTCCTTTATTATTAACTTTATGATTTATCTACGCCATTTCCTTATCACAGCCTTTAATCTAGCAATATCACAGTCTCCCAACCATGGCAGCAGCGCCTCCGATCAAATTCGGCATCCTGGGCTGCGCCGACATAGCTCGGAAGGTGTCCCGCGCGATAACCCTCTCCCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994113
ATGGCAGCAGCGCCTCCGATCAAATTCGGCATCCTGGGCTGCGCCGACATAGCTCGGAAGGTGTCCCGCGCGATAACCCTCTCCCCCAATTCCACCCTCCATGCCGTCGGCAGCCGCTCCCACGAAAAGGCGGCCAAATTCGCCGCCGAGAACGGGTTCCCGGACTCCGCGAAGGTGTACGGATCGTACGAGGCCGTGCTGGATGATCCGGAGGTGGACGCCGTGTACGTGCCGCTGCCGACGAGCCTTCACATCAAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775135.1
MAAAPPIKFGILGCADIARKVSRAITLSPNSTLHAVGSRSHEKAAKFAAENGFPDSAKVYGSYEAVLDDPEVDAVYVPLPTSLHIKWAVLAAQKKKHLLLEKPVALNATEFDQILAACESSGVQFMDGTMWMHHPRTAKMKDFLYDSSQFGLLKTVHCCFTFAAEKDFLENDIRVKPDLDALGALGDVGWYCTRSILWAADFELPKTALALRGTVKNSAGVILACSVFLQWEDGKTATFHCSFLANLTMDLTIVGTNGTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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