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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003655`

染色体: Chr01 坐标: 55001525-55004715 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003655`
名称	SmilChr01G003655
描述	probable ATP synthase 24 kDa subunit, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55001525 - 55004715 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994861`
GeneID	`130994861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994861`
原始查询	`SmilChr01G003655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ATP synthase 24 kDa subunit, mitochondrial
产物	probable ATP synthase 24 kDa subunit%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G21870` (MGP1) MALE GAMETOPHYTE DEFECTIVE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816723] identity=69.7; qcov=1; evalue=1.27e-118; confidence=high
Rice	`Os02g0131300` (OsMASP1) - identity=65.6; qcov=1; evalue=1.21e-104; confidence=high
GO	GO:0009555 (pollen development)
KEGG	-
Pfam	PF15704 (Mt_ATP_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057775955.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057775955.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057775955.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775955.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55002004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:55002027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:55002860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:55003965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:55004056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B37,B7
`Chr1:55004229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775955.1

244 aa

122

244

Mt_ATP_synt

PF15704 Mt_ATP_synt 38-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775955.1`	Pfam	`PF15704`	Mt_ATP_synt	Family	38	223	7.3e-79	264.8	Mitochondrial ATP synthase subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919972.1
AGGAGAGACATCTCAAACGACAGCGTTTCCTCGACTCCTTCATGTTCTCTCCGAGATTCCCATTTTTGCCCCTTTACCTGAATAAACTAGGGCAGTTCCAAGCGAAGTATTCTCCAAATTCCAAAAATCGAACAAAACCAGCTCCCTGCTGAATTGCTTCTGCCAATCCCAAAATGGCTTTCACCTCTCGCTTCCTCTCGAGATCCACTCGCCAGGTGTATGCTGGGCAAAGTGTTATCCGATCGGAGTATGCTATTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994861
ATGGCTTTCACCTCTCGCTTCCTCTCGAGATCCACTCGCCAGGTGTATGCTGGGCAAAGTGTTATCCGATCGGAGTATGCTATTCCGGCGCGTTCCTTTGCCAAAGGAGCTGGCGGCGCTCCCCCCACCTCCTTGAAGGGTGATGAGATGTTGAAGGGTATATTTCTTGAGGTTAAGAAGAAATTTGAGATGGCCATAGGGATCTTAAGAAAAGAGAAGATCGTCATTGCCCCTGAAGATCCTGCTGCTGTGTCCCAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775955.1
MAFTSRFLSRSTRQVYAGQSVIRSEYAIPARSFAKGAGGAPPTSLKGDEMLKGIFLEVKKKFEMAIGILRKEKIVIAPEDPAAVSQYANVMKTIREKADLFSESQRIKYTIDTRTQDIPDVRSYLLAVKDIRVKRGLIDELGAETMMMDALNKVEKELKKPLLRNDKKGMGLLKAEFDKVNQKLGIRREDLPKLEEQLELKIAKAQLEELKKDAVEAMETQKKREEFKDEEMPEVKSLDIRNFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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