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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003658`

染色体: Chr01 坐标: 55014385-55017848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003658`
名称	SmilChr01G003658
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 39-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55014385 - 55017848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994889`
GeneID	`130994889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994889`
原始查询	`SmilChr01G003658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 39-like
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 39-like
Arabidopsis	`AT4G09730` (RH39) RH39 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826559] identity=64.3; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0184500` (OsRH39) - identity=65.4; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057775996.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057775996.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775996.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775996.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55014577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C72
`Chr1:55014701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:55014707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B129,B83,C59,C61
`Chr1:55014772`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A1,A18,A22,A7,B108,B111,B115,B126,B127,B138,B20,B25,B60,B69,B72,B80,B86,B88,B97,B98,B99,C23,C28,C31,C32,C50,C68,C7,C71
`Chr1:55014791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B127,C12,C33,D6
`Chr1:55014854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B75,C38,C75,C83
`Chr1:55015498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:55015630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C72
`Chr1:55015817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:55017615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:55017631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:55017729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775996.1

634 aa

317

634

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 145-327 aa PF00271 Helicase_C 364-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775996.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	145	327	7.3e-39	133.9	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057775996.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	364	475	1.9e-29	102.8	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920013.1
ATTCCAGTGTGCAGTTCTCATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACATCCCTAAACCCCACAGCTTCAAAAACCCCAAAAACTCATTCTACAAAAAGATCGGCCCTTTCCTACTGATTTCGTACAAACCAGAAATGGGCACAACAGCAAAAGCACTCTCCACCTCTCTCCTCTCTCTACCCAAATGCCTCTATTTCCACCGCCCCCTTTACTTCTCCCTACCATTCCACGCTCACCGCCCTCCTCGCAGGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994889
ATGGGCACAACAGCAAAAGCACTCTCCACCTCTCTCCTCTCTCTACCCAAATGCCTCTATTTCCACCGCCCCCTTTACTTCTCCCTACCATTCCACGCTCACCGCCCTCCTCGCAGGGTACTCCTCCATAAATTCCGGCCACTCTGCACCGCCGCCCCCGCCGCACCGCCGGCGGTCGAAGAGGCGGAATCGTTGCAACCCTTGAAGCATTCGATTCTCCTGGAACGACTCAGGCAGCGGCACCTCAAGGACTCTCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775996.1
MGTTAKALSTSLLSLPKCLYFHRPLYFSLPFHAHRPPRRVLLHKFRPLCTAAPAAPPAVEEAESLQPLKHSILLERLRQRHLKDSPQPSKPTAAASQKVRHGVAESEGSRRKKGGAAETASSFEELGLSVEVMAALGEMGITEPTEIQCIGIPAVLDGKSVVLGSHTGSGKTLAYLLPLVQLLRRDEDLHGMLMKPRRPRAVVLCPTRELCEQVFRVSKSISHHARFRSTMVSGGGRIKPQEDSLNCPIDMVVGTPGRVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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