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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003660`

染色体: Chr01 坐标: 55020547-55025429 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003660`
名称	SmilChr01G003660
描述	type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55020547 - 55025429 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994898`
GeneID	`130994898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994898`
原始查询	`SmilChr01G003660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3-like
产物	type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3-like
Arabidopsis	`AT1G71710` (AT1G71710) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843501] identity=55.3; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0716800` - identity=50; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004439 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0004445 (inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity); GO:0034485 (phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0046856 (phosphatidylinositol dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF22669 (Exo_endo_phos2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776009.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057776009.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776009.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776009.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55021047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:55021175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B37,D10
`Chr1:55021202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B75
`Chr1:55021211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:55021225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B75,C75,C83
`Chr1:55021254`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C9
`Chr1:55021254`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C9
`Chr1:55022611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:55022650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B82
`Chr1:55022650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:55022999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,D11
`Chr1:55023021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776009.1

666 aa

333

666

Exo_endo_phos2

PF22669 Exo_endo_phos2 124-193 aa PF22669 Exo_endo_phos2 375-612 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776009.1`	Pfam	`PF22669`	Exo_endo_phos2	Domain	124	193	5.5e-75	253.3	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
`XP_057776009.1`	Pfam	`PF22669`	Exo_endo_phos2	Domain	375	612	5.5e-75	253.3	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920026.1
AAAAAAACTTAAAGTTGGAAGTCTCAAATTTGAGTCCATCATGTATATGGTAATTATTCCAAATTTAAAATAGAGTATACGTTGTGTGCATACGGTTGTTATAAACAGTGGAGGGAGAGTTGTGTCGACAGGACAACTACGGCGACGGCAGTTGACATCAATCCTCTCCCATTCTTCCCTCATTTTTCTCCTGCAACATTTACTCGCGTTTTTTTTCCTCATACAGTCCATTCCAAACTATACGCTACAGAGGATGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994898
ATGCGAAGCAACCGCCAGCAGCAGCAGCTATCCTGGCGGCGCGCGGTGCTGCGCAAGTGGCTGAACATAGCGACCAGCAACTCCGATTACTCCGCTGACAGCGACATCAGCTCTGACTCCGACTCCGAACAAGAAATTTGTGAGGGCATCAAGGAGTCCAGGTTCAAGAATGAAAAACATGATGATGTGATGTTTGATGCTAGTGGTACCGAATTTTGTGATTGGCCCAAAGAATCCAGGTTCAAGAATGAAATAGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776009.1
MRSNRQQQQLSWRRAVLRKWLNIATSNSDYSADSDISSDSDSEQEICEGIKESRFKNEKHDDVMFDASGTEFCDWPKESRFKNEIAEELKIDDNEALPRLRRRNSETFRAQYINSKEIRICAATWNVGGLTPDDDHNFDGWLDIVEPADIYVIGFQEIIPLNAGNIFGAEDTRPVQKWENIIRETLNRVPPMTRFKSYSDPPTPSRFQPPEDALDVEDEVALESESDIEEGIYPVNEDSSGFCDGGTDFVCEDASFPEDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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