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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003669`

染色体: Chr01 坐标: 55107495-55110325 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003669`
名称	SmilChr01G003669
描述	uncharacterized SmilChr01G003669
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55107495 - 55110325 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994975`
GeneID	`130994975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994975`
原始查询	`SmilChr01G003669`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0136900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0136900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G45250` (AT2G45250) integral membrane hemolysin-III-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819133] identity=41; qcov=0.277; evalue=9.59e-16; confidence=weak
Rice	`Os04g0136900` - identity=46; qcov=0.292; evalue=1.25e-16; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0070176 (DRM complex)
KEGG	-
Pfam	PF10044 (LIN52)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776178.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057776178.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057776178.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776178.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55107523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr1:55108509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B27
`Chr1:55108509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:55108516`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B18,B31,B32,B34,C37
`Chr1:55108516`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B18,B31,B32,B34,C37
`Chr1:55108771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:55108936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:55110020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C87,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776178.1

343 aa

172

343

LIN52

PF10044 LIN52 260-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776178.1`	Pfam	`PF10044`	LIN52	Family	260	324	2.5e-05	25.6	Retinal tissue protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920195.1
AAGAAATTATTTAGCACGTGATATAAATGCAGGTGAGCGCCCTCTTTTTTGAAAACCTCCTCTCCTCTCGCGCCGTCTCTCCCCACCCACCCACATCTGCTGTTGCCGATCTCCAAACCCACTCCTCCGATCACTGCTTTGGTCGGGATATATTGTGGAACTACTGCCAGGCAGGTTTACTTGCATTGACTTCTGTGATGATCAACACCGAACGTAATGCAAATGGAATGGCTGGTGGTGGGACTCCCACTCCTGCTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994975
ATGCAGGTGAGCGCCCTCTTTTTTGAAAACCTCCTCTCCTCTCGCGCCGTCTCTCCCCACCCACCCACATCTGCTGTTGCCGATCTCCAAACCCACTCCTCCGATCACTGCTTTGGTCGGGATATATTGTGGAACTACTGCCAGGCAGGTTTACTTGCATTGACTTCTGTGATGATCAACACCGAACGTAATGCAAATGGAATGGCTGGTGGTGGGACTCCCACTCCTGCTCATGATAAGAAACTTCCTGGTTCTGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776178.1
MQVSALFFENLLSSRAVSPHPPTSAVADLQTHSSDHCFGRDILWNYCQAGLLALTSVMINTERNANGMAGGGTPTPAHDKKLPGSVKKTALRDLQNENVGTIHKQQENILPGGGKSCGDTVKVCGNKRLTPERPSSSQGLPYSTYNGTNENVMNARRRFELELGMGRLHNNVEKKITSCSESKNAVSQLRQDVTQKPMKNGNLHPTPNNLTAIMAFSSSGPSVPNSLGKHGNSTPVAKISQESTHTIDFKTTNDLLRTET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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