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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003672`

染色体: Chr01 坐标: 55155753-55160483 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003672`
名称	SmilChr01G003672
描述	SWR1 complex bromodomain subunit bdf1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55155753 - 55160483 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995042`
GeneID	`130995042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995042`
原始查询	`SmilChr01G003672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SWR1 complex bromodomain subunit bdf1-like
产物	SWR1 complex bromodomain subunit bdf1-like
Arabidopsis	`AT1G20670` (AT1G20670) DNA-binding bromodomain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838655] identity=40.4; qcov=0.996; evalue=1.14e-122; confidence=medium
Rice	`Os09g0550000` - identity=45.5; qcov=0.545; evalue=1.6e-89; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00439 (Bromodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776181.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776181.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776181.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776181.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776181.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55156242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,A9,B19,C45
`Chr1:55156300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B54
`Chr1:55156356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B79,C39,D1,D10
`Chr1:55156371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:55156372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:55156635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:55156773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:55157148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:55157156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B79,C39,D1,D10
`Chr1:55159108`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B46,B52,C46
`Chr1:55159108`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B46,B52,C46
`Chr1:55159119`	`CTG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B113,B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776181.1

693 aa

346

693

Bromodomain

PF00439 Bromodomain 184-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776181.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	184	263	2.3e-26	92.3	Bromodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920198.1
AAAAAGCAGCGGAGGAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAGGCTCTCTCGCTCTCTCTGTCTCTCTCCTCTCTCACTCCAAAACCCAAAGACAATGGGTAAGGTACCAACTGCGGCAGCAGCAACAACGGAGATGAAGAGAAAGAAGAAGAAAGGCCGTCCTTTGAAGAACCCCCCTCCCCTCTCAACCCCACCCAAAGCCCCTCTTTCCAATTCCGCAAGCCGACGATCCACCCGCCGGAACCCTAATCACCTTAATTCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995042
ATGGGTAAGGTACCAACTGCGGCAGCAGCAACAACGGAGATGAAGAGAAAGAAGAAGAAAGGCCGTCCTTTGAAGAACCCCCCTCCCCTCTCAACCCCACCCAAAGCCCCTCTTTCCAATTCCGCAAGCCGACGATCCACCCGCCGGAACCCTAATCACCTTAATTCTCCGCCGCGGCCGGACTTCGATGACGACGAAGACGAGCGCAAGGAGAAGAAGGTCAAACTCGTCGTTCGCCTGCCCCAATCGGATGAGAAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776181.1
MGKVPTAAAATTEMKRKKKKGRPLKNPPPLSTPPKAPLSNSASRRSTRRNPNHLNSPPRPDFDDDEDERKEKKVKLVVRLPQSDEKTKADEKNQQQLQQSGRHSHDSDSGSESGSDYDSDPEDEDREGPAKKRKIIGDDGGSDDGGLDQDKEIVMKATDTPLQGSPLESGPTAALPEKKLLVFILDRLQKKDTYGVFSEPVDPDELPDYFDIIKHPMDFGTVRKKLESGAYKNLDELEADVDLICSNAMQYNAADTVYYR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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