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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003677`

染色体: Chr01 坐标: 55184061-55187105 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003677`
名称	SmilChr01G003677
描述	F-box/kelch-repeat protein At5g42360-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55184061 - 55187105 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995113`
GeneID	`130995113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995113`
原始查询	`SmilChr01G003677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At5g42360-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At5g42360-like
Arabidopsis	`AT5G42360` (AT5G42360) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834242] identity=53.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0555300` (OsFbox503) - identity=41; qcov=1.04; evalue=5.32e-124; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF01344 (Kelch_1); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776244.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776244.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776244.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776244.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55184588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B69,B90,B92,D6
`Chr1:55184600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B69,B90,B92,D6
`Chr1:55184657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C74
`Chr1:55184732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:55184835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:55184894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C74
`Chr1:55184966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C5,C74
`Chr1:55184968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:55185005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B105,B29,B75,C30
`Chr1:55185045`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	114	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A20,A24,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B107,B108,B111,B113,B115,B117,B12,B120,B121,B125,B128,B130,B132,B133,B139,B19,B22,B23,B24,B25,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B44,B47,B5,B51,B57,B59,B60,B61,B64,B66,B67,B69,B7,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B86,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C14,C15,C19,C23,C24,C25,C26,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C40,C45,C5,C50,C60,C63,C65,C68,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C81,C82,C84,C86,D10,D2,D6,D9
`Chr1:55185047`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	114	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A20,A24,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B107,B108,B111,B113,B115,B117,B12,B120,B121,B125,B128,B130,B132,B133,B139,B19,B22,B23,B24,B25,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B44,B47,B5,B51,B57,B59,B60,B61,B64,B66,B67,B69,B7,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B86,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C14,C15,C19,C23,C24,C25,C26,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C40,C45,C5,C50,C60,C63,C65,C68,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C81,C82,C84,C86,D10,D2,D6,D9
`Chr1:55185461`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A1,A18,A5,A7,A9,B111,B115,B117,B128,B138,B19,B25,B33,B35,B47,B60,B64,B72,B77,B80,B86,B88,B94,B97,B98,B99,C3,C32,C45,C50,C65,C68,C7,C71,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776244.1

580 aa

290

580

F-box-like

F-box

Kelch_1

PF12937 F-box-like 136-169 aa PF00646 F-box 136-170 aa PF01344 Kelch_1 223-277 aa PF01344 Kelch_1 371-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776244.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	136	169	4.2e-07	30.3	F-box-like
`XP_057776244.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	136	170	4e-10	39.9	F-box domain
`XP_057776244.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	223	277	2.6e-16	59.5	Kelch motif
`XP_057776244.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	371	404	2.6e-16	59.5	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920261.1
ATGAGCAGCAGCATAAACGAAAAGCGGTTGTGGGACTCTCTCACATAATCATTCCATCCACATATTTGAAAAAAGTAGTAAAAGAAAGAACAAAATTAGCAAATATAATCACAAAAATTCAAAAAGCAGAAAGAGTGCTGATATATGTAATGGGAGGAAGGTAAAGGAAACAGAGGTGTCGCTTTTGCAAATTTCTCAAGTTTTATCAGATTGGATCTGATGGGCTTGCCCCTGATCTTCTGTAGAGTGAATCTTGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995113
ATGGCCTCTCCGAGATTAATGGGAGAAGAAATTATCAACCAAGAGATTGAGCCTAGGAGTGTTTCAAAACGCCTTGTACGAAGTATGAGCCAGAAGTTGAAAAGGAAGAGCCAAAAGAATGAAAGTTCTGAAGATGATGAGACGAGTGGCGTCTCTTTGAGATGTCTTACCCTCTACGGCAGGGGAGGTGGGTGCAGAGTGAGTGCTGATATGGATGAGGAGTCCGGGGATCCGGGCAGTAGGAGGAGATCGAGTGCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776244.1
MASPRLMGEEIINQEIEPRSVSKRLVRSMSQKLKRKSQKNESSEDDETSGVSLRCLTLYGRGGGCRVSADMDEESGDPGSRRRSSASEDGKGTTWGKDDASVDCFSIGMDRFFRRNNNRRLLKCSVVEQSNSMNARLPDDVLEMCLVRLPLASLVNARLVCKKWRNLTATARFMQIRREGSFLSSWLFVFGLVKNGYCSGEIHALDVSQNQWHKIDSQILKGRFFFSVASIHDDVYVVGGCSSLTNLGRVDRSSFKTHKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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