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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003682`

染色体: Chr01 坐标: 55219609-55220499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003682`
名称	SmilChr01G003682
描述	RING-H2 finger protein ATL80-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55219609 - 55220499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995170`
GeneID	`130995170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995170`
原始查询	`SmilChr01G003682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL80-like
产物	RING-H2 finger protein ATL80-like
Arabidopsis	`AT1G20823` (AT1G20823) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838674] identity=63.1; qcov=0.87; evalue=2.36e-62; confidence=high
Rice	`Os02g0832150` (OJ1149_C12.20) - identity=44.6; qcov=0.913; evalue=4.38e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776307.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057776307.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057776307.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057776307.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55219910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:55219975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:55220023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B38
`Chr1:55220023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr1:55220061`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr1:55220061`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr1:55220083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A9,B104,B87
`Chr1:55220106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C48,C86
`Chr1:55220128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B87,C48,C86
`Chr1:55220132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B87,C38,C48,C86
`Chr1:55220189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:55220262`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776307.1

184 aa

184

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-ANAPC11

PF17123 zf-RING_11 101-130 aa PF13639 zf-RING_2 101-144 aa PF00097 zf-C3HC4 102-143 aa PF13923 zf-C3HC4_2 102-143 aa PF12861 zf-ANAPC11 111-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776307.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	101	130	3.7e-12	46.4	RING-like zinc finger
`XP_057776307.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	101	144	1.5e-14	54.6	Ring finger domain
`XP_057776307.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	102	143	2.5e-06	28.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057776307.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	102	143	3.9e-08	33.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057776307.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	111	150	1.8e-06	28.6	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920324.1
CAAACAAACATTATATATATATAGCACTCAAATATTGTAGGATACATACATAAATAAACGTGTGTAGAGCGGCGGCAAGACTTATCTTATCCCTTATCAGCTAATTCAAATGTCAGTTTTTTAATTTTCGAAGAAATTCAAATTTCAGTTAAAAAGTTGCTTCTCCAACTACCTTTCCTTATATAAAACCCAGCTTAATTCCAAACCTCCATCCACACCTCAACGCTACTCCTTACTCCCTTTCTCTCTCTACATGACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995170
ATGACTGCCCGCTCTCTCCTCGGCGGCGCAAACTCGCCGCCGTCTCGCGACTCCTCCGCGGCGATCGAAGCAATCGATTCCGACTTCATAGTGATCATCGCCGCTCTCCTCTGCGCCCTAATCTGCGTGCTCGGACTCGTCGCCGTCTCGCGCTGCTCCTGGATCCGCCGCCTCGCCGGAAGATATCCGGCATCGTCGCCGGCGACCGCCTCCAGCAAAGGCCTGAAGAAGAAGGTTCTGAAATCGCTGCCGAAGCTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776307.1
MTARSLLGGANSPPSRDSSAAIEAIDSDFIVIIAALLCALICVLGLVAVSRCSWIRRLAGRYPASSPATASSKGLKKKVLKSLPKLTYGQGNELEAAKLHDCAICLAEFAAGDEVRVLPQCGHGFHVGCVDTWLASHASCPSCRQILEVARCRKCGRLPPSTGCSVAGLRPEPRESIVSIGFIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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