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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003686`

染色体: Chr01 坐标: 55238048-55240022 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003686`
名称	SmilChr01G003686
描述	protein CUP-SHAPED COTYLEDON 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55238048 - 55240022 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995194`
GeneID	`130995194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995194`
原始查询	`SmilChr01G003686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CUP-SHAPED COTYLEDON 3
产物	protein CUP-SHAPED COTYLEDON 3
Arabidopsis	`AT1G76420` (CUC3) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843975] identity=62.1; qcov=0.749; evalue=7.09e-104; confidence=high
Rice	`Os08g0511200` (OsCUC3) - identity=67.5; qcov=0.684; evalue=7.09e-97; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776336.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776336.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776336.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776336.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55238388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:55238512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:55238583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:55238637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B22,B41,C72
`Chr1:55238668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:55238887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:55239238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B22,B41,C72
`Chr1:55239295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:55239370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B22,B41,C72
`Chr1:55239395`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr1:55239395`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr1:55239454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A15,B32,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776336.1

342 aa

171

342

NAM

PF02365 NAM 20-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776336.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	20	146	7.7e-47	159.5	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920353.1
ATTTACTCCTTCCCTCCAACCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGAATATTATTTTGCCTGTTTTGGAACCCATCTCAGGTGGCTTTTACAGGCCCTCTGCAGATTAGCCTTTATGACGACCCCTCCCAAATCTATTCCATTTCCCTTCGGATTCAGTGCTTCAATTCCCCCACACTCCCAATTATATAAATAACCAACACGACCGCAACCGCAACTATCAAATTCAAATCCAATTTCTCATGTTGGGAATGGAAGAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995194
ATGTTGGGAATGGAAGAGATTCTGTGTGAGCTCCAGAGAGACGATCAGCAAGGCCTGCCTCCTGGCTTCAGATTCCACCCCACCGATGAAGAGCTCATCACCTTCTACTTAGCTTCCAAGGTCTTCAATGGCGCCTTCTGCGGCGTCGACATCGCCGAAGTCGACCTCAATCGCTGCGAGCCCTGGGAGCTTCCGGATGCCGCGAAGATGGGGGAGAGGGAGTGGTATTTCTTCAGCTTGAGGGACCGGAAATACCCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776336.1
MLGMEEILCELQRDDQQGLPPGFRFHPTDEELITFYLASKVFNGAFCGVDIAEVDLNRCEPWELPDAAKMGEREWYFFSLRDRKYPTGLRTNRATGAGYWKATGKDREVVSAANGGLLGMKKTLVFYKGRAPRGEKTKWVMHEYRLDGDFSCRHTGKEEWVICRIFHKMGEKKSLMPGQSYLLRGSSFYNPITNSLPALLDPHQDLPNPLLYHTSCHQDQSELKALINPLVSRPDFLPVGINPIQAKDSSSSFFLKPLMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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