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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003692`

染色体: Chr01 坐标: 55288840-55293103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003692`
名称	SmilChr01G003692
描述	uncharacterized SmilChr01G003692
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55288840 - 55293103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010251`
GeneID	`131010251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010251`
原始查询	`SmilChr01G003692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=33.2; qcov=0.751; evalue=2.88e-26; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=45.1; qcov=0.845; evalue=2.79e-63; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793673.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793673.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057793673.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793673.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55288856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C11,C28
`Chr1:55288937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:55288938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:55288964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:55292401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A11,A15,B1,B101,B102,B104,B107,B108,B109,B115,B117,B12,B121,B125,B13,B20,B24,B3,B32,B44,B46,B55,B57,B66,B75,B82,B85,B89,B90,B92,B93,C14,C25,C28,C29,C31,C35,C44,C55,C74,C75,C8,C82,C84,D6,D7
`Chr1:55292404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:55292409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:55292412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B46,C25,C31,C5
`Chr1:55292413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	97	A13,A19,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A8,B102,B106,B110,B119,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B131,B134,B136,B137,B15,B16,B18,B19,B21,B26,B3,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B53,B6,B62,B63,B65,B69,B7,B70,B77,B8,B82,B83,B84,B87,B95,B97,C1,C12,C13,C14,C17,C2,C22,C27,C28,C32,C33,C36,C41,C43,C46,C51,C52,C54,C59,C6,C61,C62,C67,C68,C7,C70,C72,C77,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D3,D4,D6,D9
`Chr1:55292423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C25,C31,C5
`Chr1:55292423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C31,C5
`Chr1:55292424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A11,B10,B114,B135,B136,B137,B138,B54,B58,B79,C3,C39,C51,C86,C9,D1,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793673.1

265 aa

132

265

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 60-121 aa PF04827 Plant_tran 121-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793673.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	60	121	1e-47	163.2	Plant transposon protein
`XP_057793673.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	121	207	1e-47	163.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937690.1
ATGATGCACGAGGTCGGGACTCTCTCACTCCTTTTGCAGAAATGCACGACGCCTATCTGCCAATTATCCACCGGCGTTAGTGCGGATACTTTCAACGAGTATCTCAAGGTCGCCGATACGACGCGGCGTCTATGCCTCAAGAGATTCTGCAAGGCTGTCATCTGGGCTTACTCAGGCGAGTATCTTCAACGTCCGACACAGGCGGACATCCAACACCTTCTTCAGATGCATGAGGCGCGACACGGATTTCATAGGATGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010251
ATGATGCACGAGGTCGGGACTCTCTCACTCCTTTTGCAGAAATGCACGACGCCTATCTGCCAATTATCCACCGGCGTTAGTGCGGATACTTTCAACGAGTATCTCAAGGTCGCCGATACGACGCGGCGTCTATGCCTCAAGAGATTCTGCAAGGCTGTCATCTGGGCTTACTCAGGCGAGTATCTTCAACGTCCGACACAGGCGGACATCCAACACCTTCTTCAGATGCATGAGGCGCGACACGGATTTCATAGGATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793673.1
MMHEVGTLSLLLQKCTTPICQLSTGVSADTFNEYLKVADTTRRLCLKRFCKAVIWAYSGEYLQRPTQADIQHLLQMHEARHGFHRMLGSLDCMHWAWKSCPKAWHDAYTRGDQGEPTLILKSPLFSDVLDGTAAPVIFEANRHYYQMGYYLCDGLYPEWCCFVKSPPMVTNPNEARFKKMQQSAQKDVERAFGVLQARWKIIRSSAQGIGDFARINLGVLLDIFGDFESINEGALLGIFGVLHSSIKEFCLTSLELCTHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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