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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003693`

染色体: Chr01 坐标: 55297484-55299992 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003693`
名称	SmilChr01G003693
描述	psbP domain-containing protein 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55297484 - 55299992 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995258`
GeneID	`130995258`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995258`
原始查询	`SmilChr01G003693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	psbP domain-containing protein 3, chloroplastic
产物	psbP domain-containing protein 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G76450` (AT1G76450) Photosystem II reaction center PsbP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843978] identity=57.5; qcov=0.86; evalue=4.21e-94; confidence=high
Rice	`Os08g0512500` - identity=57.2; qcov=0.695; evalue=1.81e-73; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995258

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776464.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057776464.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057776464.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776464.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776464.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55297503`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B73,C83
`Chr1:55297503`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B73,C83
`Chr1:55297505`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:55297505`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:55297552`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr1:55297552`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr1:55297559`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	143	A11,A13,A15,A16,A18,A19,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B102,B107,B110,B114,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B15,B16,B18,B19,B20,B21,B22,B26,B29,B3,B30,B32,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B53,B54,B58,B6,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B73,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B87,B9,B95,B97,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C19,C2,C22,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C39,C41,C43,C46,C51,C52,C53,C58,C59,C6,C61,C62,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C74,C77,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D3,D4,D6,D8,D9
`Chr1:55297747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:55298771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:55299612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B136,C27,C54,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776464.1

279 aa

140

279

PsbP

PF01789 PsbP 118-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776464.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	118	277	1.1e-27	97.7	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920481.1
TTATAGAGTTTATGAAAATTATTACAACCAAACAAAGAGATTCAAGAAAATCACAAAAATCAATTTACATCCCAACTTTTCTCCAACTGCAGCAAAAATCAATGGCCCCTATTTTCTCTTTGCACTCTCATTCCCTTCTCTCTCATCCCTCATTTTCACCTCCGCAACAAGAAATAAGGAGGAACAAGAATTCCTGCTTTATCTGCTGCAAGAGCAATGTGGTTGATCAGCAAAATCAATGCGTGAGCGTTGGAGATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995258
ATGAAAATTATTACAACCAAACAAAGAGATTCAAGAAAATCACAAAAATCAATTTACATCCCAACTTTTCTCCAACTGCAGCAAAAATCAATGGCCCCTATTTTCTCTTTGCACTCTCATTCCCTTCTCTCTCATCCCTCATTTTCACCTCCGCAACAAGAAATAAGGAGGAACAAGAATTCCTGCTTTATCTGCTGCAAGAGCAATGTGGTTGATCAGCAAAATCAATGCGTGAGCGTTGGAGATGAATGCAAGAAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776464.1
MKIITTKQRDSRKSQKSIYIPTFLQLQQKSMAPIFSLHSHSLLSHPSFSPPQQEIRRNKNSCFICCKSNVVDQQNQCVSVGDECKKRRRELLVQAVSAVFAFPTVSSAALAAETALPEGFRVYTDEVNKFKIAIPEDWQVGTGEGDGVRALIAFYPQDASSSNVSIAITGLGADFTRLESFGKVGEFAETLIGGLDRSWQRPPGVTAKLIDSRSANGLYYIEYTLKNPGESGRHLYSVLGVANNGIYNRLYTLTGQFVDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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