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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003695`

染色体: Chr01 坐标: 55305291-55310361 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003695`
名称	SmilChr01G003695
描述	uncharacterized SmilChr01G003695
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55305291 - 55310361 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995262`
GeneID	`130995262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995262`
原始查询	`SmilChr01G003695`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843979]; symbol=AT1G76460; hit=AT1G76460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843979]; symbol=AT1G76460; hit=AT1G76460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G76460` (AT1G76460) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843979] identity=61.8; qcov=0.997; evalue=1.9e-121; confidence=high
Rice	`Os02g0714000` - identity=55.6; qcov=0.92; evalue=1.83e-97; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776477.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776477.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776477.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776477.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776477.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55306254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B123
`Chr1:55307054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776477.1

318 aa

159

318

RRM_1

PF00076 RRM_1 38-94 aa

XP_057776484.1

307 aa

154

307

RRM_1

PF00076 RRM_1 38-94 aa

XP_057776492.1

300 aa

150

300

RRM_1

PF00076 RRM_1 38-94 aa

XP_057776500.1

289 aa

144

289

RRM_1

PF00076 RRM_1 38-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776477.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	38	94	1.1e-16	61.2	RNA recognition motif
`XP_057776484.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	38	94	1e-16	61.3	RNA recognition motif
`XP_057776492.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	38	94	1e-16	61.3	RNA recognition motif
`XP_057776500.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	38	94	9.5e-17	61.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920517.1
GAAAGAGATGGCCCACGAACTGGCCCTTCCAAGCTGTATTTCTTCCATGTTTGGAAATTCGGAAGCAGCTGTCCTTCCATACCCTCAGCTTTCTCTTCTTCCTCATTCATACCAATACACATTCTCTCTCTAAATTTGAAACAAAAATTAAACCCTTTAATTAAATTTTTTTTTTTAAATACAGAAAGATCATGACAACTCTGTTCCAGATCATCTCTCTCCATCATCATCACCCTCTCCCCGATCACAATTTCAAACCC...

XM_057920501.1
GCCCTTCCAAGCTGTATTTCTTCCATGTTTGGAAATTCGGAAGCAGCTGTCCTTCCATACCCTCAGCTTTCTCTTCTTCCTCATTCATACCAATACACATTCTCTCTCTAAATTTGAAACAAAAATTAAACCCTTTAATTAAATTTTTTTTTTTAAATACAGAAAGATCATGACAACTCTGTTCCAGATCATCTCTCTCCATCATCATCACCCTCTCCCCGATCACAATTTCAAACCCAAAACCCTCCTTTTCCCTATTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130995262
ATGGCTTATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCATGCCCGGCCCGAGCTCGGGCTCGGGGCAGGGCGGGTACCAATATATGAATTCTCCATTTGGGGATACCACTTTCACTAAGGTTTTCGTGGGAGGGTTGGCTTGGGAAACTCAGAGTGAGACGATGATGCGTTATTTCGAGCAATTTGGAGAGATTCTCGAGGCCGTGGTCATCACCGATAAGAATACTGGCCGATCCAAAGGATACGGTTTTGTGACTTTCCGGGATCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057776477.1
MAYQQQQQQPMPGPSSGSGQGGYQYMNSPFGDTTFTKVFVGGLAWETQSETMMRYFEQFGEILEAVVITDKNTGRSKGYGFVTFRDPESARRACADPTPIIDGRRANCNLASLGRPRPAIPFGRLRSPAPYLGGQPAARGAYVGNFGYQQPVTYGFQQGLMYSPYGGGHSPRVNWNATQTGLVRYAAYGPEYAYPQGVYNPYGNQQYLHIYGMPGTVGTTMYPYSQLSQAVPGSHNYTALPGYAMPGHQIVQFGGPSVNA...

XP_057776484.1
MAYQQQQQQPMPGPSSGSGQGGYQYMNSPFGDTTFTKVFVGGLAWETQSETMMRYFEQFGEILEAVVITDKNTGRSKGYGFVTFRDPESARRACADPTPIIDGRRANCNLASLGRPRPAIPFGRLRSPAPYLGGQPAARGAYVGNFGYQQPVTYGFQQGLMYSPYGGGHSPRVNWNATQTGLVRYAAYGPEYAYPQGVYNPYGNQQYLHIYGMPGTVGTTMYPYSQLSQAVPGSHNYTALPGYAMPGHQIVQFGGPSVNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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