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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003702`

染色体: Chr01 坐标: 55403087-55405519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003702`
名称	SmilChr01G003702
描述	bZIP transcription factor 60
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55403087 - 55405519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995323`
GeneID	`130995323`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995323`
原始查询	`SmilChr01G003702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bZIP transcription factor 60
产物	bZIP transcription factor 60
Arabidopsis	`AT1G42990` (BZIP60) basic region/leucine zipper motif 60 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840897] identity=36.1; qcov=0.948; evalue=2.27e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0622700` (BZIP50) - identity=47; qcov=0.514; evalue=2.2e-33; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776557.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776557.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776557.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776557.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55403336`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A8,B104,B2,B24,B79,B83,C39,C48,C59,C8,D1,D7
`Chr1:55404890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C53
`Chr1:55404919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:55405010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C25
`Chr1:55405290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A15,B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776557.1

327 aa

164

327

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 145-188 aa PF00170 bZIP_1 146-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776557.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	145	188	1.5e-05	25.6	Basic region leucine zipper
`XP_057776557.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	146	190	3.1e-07	31.1	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920574.1
GACGGTTCAGATCACCCGCCACCTCTCCTTAACCGCGAAGGCAGCAGAAATATCCACGCAGTTGCGCTCCCGCTCCGCCGGGCTCCATAAAACCTGCAGAAATCATCTCTTTCATCTTTGTAAATTCCGTCTTCTACAGTTCCACCGTCAACGTTCATTTTTCTTTTCTTTTTCGATTTGTTGTTATTCTGTTCTGTTCAGTTTAGGGTTAATGGTTGATCGCGGAGTTCTGGGAGATGAACTGAACATCGATTGGGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995323
ATGGTTGATCGCGGAGTTCTGGGAGATGAACTGAACATCGATTGGGATAATCTTTTGGAAAATTTGCCCGATGACCTCTGCTTCGATTTAGGCAACCTTCCGCCGGCGGATGGGTTGTCTACGTCACCAGATTCCGGCTGTTCTCTGTCGATCGATGACATAGAGCAGTATCTCTTGAACGATGAGTCCTACAAGCCGGCGGATGAGAAAGATGGTTTAGCCGATGAGTTTGTTGCGGACGTGCTTCTCGATTGTTTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776557.1
MVDRGVLGDELNIDWDNLLENLPDDLCFDLGNLPPADGLSTSPDSGCSLSIDDIEQYLLNDESYKPADEKDGLADEFVADVLLDCFPGSESDSDRVKDSSASPELVDVVNCEEEKEREKPQENGADGMQTGENCAADDDGDADDPDAKKLKRQLRNRDAAVRSRERKKMLVRDLEMKSKYYEAECKRLGILLQCCLAENQALRLSLHSGQAFDASRTKQESAVLLLESLLLGSLLGFLGIIYLLILPSQLLSALEVSLLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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