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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003716`

染色体: Chr01 坐标: 55494726-55498773 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003716`
名称	SmilChr01G003716
描述	uncharacterized SmilChr01G003716
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55494726 - 55498773 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995466`
GeneID	`130995466`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995466`
原始查询	`SmilChr01G003716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0141900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os10g0141900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0141900` - identity=55.8; qcov=1.06; evalue=2.25e-143; confidence=high
GO	GO:0008479 (tRNA-guanosine(34) queuine transglycosylase activity); GO:0101030 (GO:0101030)
KEGG	-
Pfam	PF01702 (TGT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995466

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776739.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776739.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776745.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057776739.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55494968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B137
`Chr1:55495020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:55496516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B16,B56,B96
`Chr1:55496566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B113,B133,B33
`Chr1:55496975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,C2,C32,C68
`Chr1:55497975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:55498475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:55498476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C74
`Chr1:55498477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B29,B59,C30
`Chr1:55498492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:55498507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B29,B59,C30
`Chr1:55498550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B16,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776739.1

399 aa

200

399

TGT

PF01702 TGT 12-389 aa

XP_057776745.1

375 aa

188

375

TGT

PF01702 TGT 12-181 aa PF01702 TGT 211-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776739.1`	Pfam	`PF01702`	TGT	Domain	12	389	2.1e-88	297.6	Queuine tRNA-ribosyltransferase
`XP_057776745.1`	Pfam	`PF01702`	TGT	Domain	12	181	1.7e-70	238.7	Queuine tRNA-ribosyltransferase
`XP_057776745.1`	Pfam	`PF01702`	TGT	Domain	211	365	1.7e-70	238.7	Queuine tRNA-ribosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092178.1
GATTTATCTTACCATGAAATATCGAAATTAATTAAAAGGTCCAAACAAACAAAAGCCTGCATACATTGTTCCGTTTTCTTTTTTCCTTATTGGTACTATAATCTAGTAAGAAAAATCAAAGTATAAATATTACAAGAGGCAGCCGCCCGCCAACTGAACCAAGGGAGGGAAAAAGCAAACAAGATAGATAGATAGAGAGAGAGACAGGGGATGAGGTTCAGCGTGAAGGGATGGAGCAAGGGCGGCGCCCGGGCAGGTGT...

XM_057920756.1
GATTTATCTTACCATGAAATATCGAAATTAATTAAAAGGTCCAAACAAACAAAAGCCTGCATACATTGTTCCGTTTTCTTTTTTCCTTATTGGTACTATAATCTAGTAAGAAAAATCAAAGTATAAATATTACAAGAGGCAGCCGCCCGCCAACTGAACCAAGGGAGGGAAAAAGCAAACAAGATAGATAGATAGAGAGAGAGACAGGGGATGAGGTTCAGCGTGAAGGGATGGAGCAAGGGCGGCGCCCGGGCAGGTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995466
ATGAGGTTCAGCGTGAAGGGATGGAGCAAGGGCGGCGCCCGGGCAGGTGTGTTGCAGGTGGGCGGCTGCTCGCTGGAAACTCCGGCGCTCCTTCTCACTACTCGCAAGGGTCTACCCGCCTTCATCTCCCCCGACCTCCTCCCTTCTCTCCCCACACCCGATTCTCGCCTCCTCCAGTTCAGCCCCCTTCACTTTGTAGAAGGCATATCGTTGAAAGCAATATCCGAGATGGGAGGGCTGCATCAGATGGTTGGTTTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776739.1
MRFSVKGWSKGGARAGVLQVGGCSLETPALLLTTRKGLPAFISPDLLPSLPTPDSRLLQFSPLHFVEGISLKAISEMGGLHQMVGLKEHVFAANPADSIISIPDFQSTNKIGASFETPSGRFLIKPGQYVEMISSMKPNLWVTLADEVPAWVSEKRNRASVERTMRWLDDCLALAKANNTGGAVFGSIVGGSKVNERKYCAQEVSRRNVSGFHISGFGLGESMDERPALLSAVTECLPDDKPRQISGLGLPEEVLQGVAA...

XP_057776745.1
MRFSVKGWSKGGARAGVLQVGGCSLETPALLLTTRKGLPAFISPDLLPSLPTPDSRLLQFSPLHFVEGISLKAISEMGGLHQMVGLKEHVFAANPADSIISIPDFQSTNKIGASFETPSGRFLIKPGQYVEMISSMKPNLWVTLADEVPAWVSEKRNRASVERTMRWLDDCLALAKANNVFTSVALVLERVWMNALLFSVLLLYGLCCFRECLPDDKPRQISGLGLPEEVLQGVAAGIDLFNSTYIYHLTVGGFALTFPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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