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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003717`

染色体: Chr01 坐标: 55499497-55502956 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003717`
名称	SmilChr01G003717
描述	uncharacterized SmilChr01G003717
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55499497 - 55502956 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995478`
GeneID	`130995478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995478`
原始查询	`SmilChr01G003717`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776760.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776760.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776760.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776760.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55500143`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A2,B125,B50,B59,B69
`Chr1:55500143`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A2,B125,B50,B59,B69
`Chr1:55500153`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr1:55500153`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr1:55500154`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A11,A7,B101,B108,B129,B13,B25,B29,B30,B35,B43,B49,B73,B89,B90,B92,C1,C22,C26,C7,C83,D2
`Chr1:55500162`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr1:55500162`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr1:55500169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B34
`Chr1:55500186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr1:55500221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:55500304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B128,B17,B65,C87
`Chr1:55500326`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A24,A7,B100,B121,B132,B137,B25,B29,B37,B49,B52,B59,B67,B94,B96,B99,C15,C26,C32,C37,C5,C58,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920785.1
CTTATGATCCCAGTATTTTATTATATATCTGTGCTTGCAAATTTTTGCCAATTCATTGTAGTTTTTAAATAAAATTAATTGATTTTTAAAATGATTTATATGTACATAAAAACAAAATTCAAAATTTATTGTGTTAAATATTCCCCATGCATTGCATGGTAGCTTAAATACAAATAGTCTCTCCAATCCATCCCAATTAAGCTATCAATGGAGGAAAGGGGTAAAGGCGTAAAGCGCGGTTATTGTGATTCGACTGAAAC...

XM_057920777.1
TATGATCCCAGTATTTTATTATATATCTGTGCTTGCAAATTTTTGCCAATTCATTGTAGTTTTTAAATAAAATTAATTGATTTTTAAAATGATTTATATGTACATAAAAACAAAATTCAAAATTTATTGTGTTAAATATTCCCCATGCATTGCATGGTAGCTTAAATACAAATAGTCTCTCCAATCCATCCCAATTAAGCTATCAATGGAGGAAAGGGGTAAAGGCGTAAAGCGCGGTTATTGTGATTCGACTGAAACTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995478
ATGGAGGAAAGGGGTAAAGGCGTAAAGCGCGGTTATTGTGATTCGACTGAAACTGTGCAGCCAGTCGTCATCGTGAACGAACTGCAGCCAGTCCTCATCGTGAACGAACCTGGATATGTCGCTGCTGTTGGGGGCATCCCAGATCACCTTAAAATTAAGGGCGGGCTGTCATATGGGATTCGCTTTCCCATTTCCAAGTATCCCAAAAATCTGCCTGAAGATCCTATTGAACGGCGAAGGGCTTTCTTTAAAGATTTCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776760.1
MEERGKGVKRGYCDSTETVQPVVIVNELQPVLIVNEPGYVAAVGGIPDHLKIKGGLSYGIRFPISKYPKNLPEDPIERRRAFFKDFEDIHTQKKPRRACSLCKQLLPEEYFIVHINSSGNHPADFYDSRAPESIPSQSMEEREEDGCSYHTIENGAVVINEPGFVAVVGGIPQDLKINDGISFSTPCPVLKYPKVMPEDPTERQNVIYECYKKGMESDAFINAFLQAYIKAKSEAQGLSSSSICHQQEEAHNMDQQPPTT...

XP_057776768.1
MEERGKGVKRGYCDSTETVQPVVIVNELQPVLIVNEPGYVAAVGGIPDHLKIKGGLSYGIRFPISKYPKNLPEDPIERRRAFFKDFEDIHTQKKPRRACSLCKQLLPEEYFIVHINSSGNHPADFYDSRAPESIPSQSMEEREEDGCSYHTIENGAVVINEPGFVAVVGGIPQDLKINDGISFSTPCPVLKYPKVMPEDPTERQNVIYECYKKGMESDAFINAFLQAYIKAKSEAQGLSSSSICHQQEEAHNMDQQPPTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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