当前解析结果
SmilChr01G003718| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003718 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003718 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003718 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 55517530 - 55519386 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010305 |
|---|---|
| GeneID | 131010305 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010305 |
| 原始查询 | SmilChr01G003718 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010305 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057793747.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057793747.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057793747.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057793747.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793747.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:55518022 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B29,B59,C30 |
Chr1:55518040 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
Chr1:55518375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:55519364 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A5,B47,C37,C42 |
Chr1:55519364 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | A5,B47,C37,C42 |
Chr1:55519370 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A6,B14,B31,B36,B49,C16 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。