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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003723`

染色体: Chr01 坐标: 55542510-55552134 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003723`
名称	SmilChr01G003723
描述	uncharacterized SmilChr01G003723
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55542510 - 55552134 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995522`
GeneID	`130995522`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995522`
原始查询	`SmilChr01G003723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Alkaline-phosphatase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831589]; symbol=AT5G17250; hit=AT5G17250; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Alkaline-phosphatase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831589]; symbol=AT5G17250; hit=AT5G17250; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G17250` (AT5G17250) Alkaline-phosphatase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831589] identity=55.5; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0170300` - identity=51.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process); GO:0051377 (mannose-ethanolamine phosphotransferase activity)
KEGG	smil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01663 (Phosphodiest)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995522

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057776825.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057776825.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776825.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776825.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55543071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B20,C28,C31
`Chr1:55543246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B21
`Chr1:55543975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B7,C80
`Chr1:55543981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:55544047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B7,C80
`Chr1:55544282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:55544309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,D4
`Chr1:55544445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B41,C53
`Chr1:55544636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B29,B59,C30,C60
`Chr1:55544837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:55544943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B136,C54,C55,D10
`Chr1:55545072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B20,C28,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776825.1

949 aa

474

949

Phosphodiest

PF01663 Phosphodiest 218-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776825.1`	Pfam	`PF01663`	Phosphodiest	Family	218	303	1.6e-09	38.6	Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920842.1
ATTAGGGATGACACGAGGAGGGAGGAATATTAAGCTAAAGATCAAAGATAATCACAATTTTCTACCGTTTTGGCGAGAAACCATATGCTGTGATCGTTAGTCCAGTGAAGTCTCTGCACAAAATTTACCTTACTAGCTTCAATTCGCTCTCTGCTTCTGCCTTAATTCACCATAACTCCATTTTGGTTAAGCTCAAGCAGATTCAGTGAAGCATTCACTCATTTATTTAGTTTCCTCCTCAGATTCTGAATTAACAACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995522
ATGGGGATATCAGAGAAACGGATTTGGAGAAGCGAGAATTGGATTGGGCGTGGATGGGCTTTCTCTGCGTTCCTGGGAATAATGCTGCTTCACAGCTTGGCCATTTTGCTGTTTACGAGAGGTTTCCTTCTTACTCGCACGGAGCTTTCCCAATATAGTGAATGCAACGACGTCTTGGAGTCGCCCTGCTTTGCTCCTACTCGCGATCAAAATGATGCTAACGGAAGTTGTTGGACCAAGCCTGTTGTTGGCCGTCTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776825.1
MGISEKRIWRSENWIGRGWAFSAFLGIMLLHSLAILLFTRGFLLTRTELSQYSECNDVLESPCFAPTRDQNDANGSCWTKPVVGRLVIIVLDALRFDFVAPSTFFAEKKPWMDRLQVMHELAARNQSSTRIFKAIADPPTTSLQRLKGLTTGGLPTFIDVGNSFGAPAILEDNLIHQLVQNGKRVVMMGDDTWVQLFPDHFATSYPFPSFNVKDLDTVDNGCITNLFPTLYKEDWDVLIAHFLGVDHAGHIYGVDSAPMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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