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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003725`

染色体: Chr01 坐标: 55567220-55572343 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003725`
名称	SmilChr01G003725
描述	ankyrin repeat protein SKIP35
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55567220 - 55572343 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995538`
GeneID	`130995538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995538`
原始查询	`SmilChr01G003725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat protein SKIP35
产物	ankyrin repeat protein SKIP35
Arabidopsis	`AT3G59910` (AT3G59910) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825161] identity=71.7; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0246900` - identity=73.1; qcov=0.799; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28568 (SKIP35_N); PF28612 (SKIP35_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776847.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057776847.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776847.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776847.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55569498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr1:55571530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,C11,C21,C69,D11
`Chr1:55571726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:55571728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:55571736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D2
`Chr1:55571839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C11,C21,C69
`Chr1:55571880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:55571978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776847.1

647 aa

324

647

SKIP35_N

SKIP35_C

PF28568 SKIP35_N 128-354 aa PF28612 SKIP35_C 545-635 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776847.1`	Pfam	`PF28568`	SKIP35_N	Repeat	128	354	4.4e-134	445.9	SKIP35 N-terminal domain
`XP_057776847.1`	Pfam	`PF28612`	SKIP35_C	Repeat	545	635	3e-42	142.9	SKIP35 C-terminal ankyrin repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920864.1
TGATGGGAAAAACAGCAATTTTTGGCGAACAAAAAACAGATGAAAACAAAAGAGCTGAGGAGTGAGGACCATACACAGAAAGACAGAGGCAACCACCAACATGGCTTCTCTCTCTACCTCTCTCCACTCATAATTTTTTAGGAATTTGGTAGAGGGATCTGCTTCTGATGTATTTGGAGGTTTGGAGGTGAAGGGTATTTAAATTTTCAGATGATTAGGAAGATGGAGGAAATTTTATGATTCAAGGCTGGAAGGCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995538
ATGGAGACAAAGAAGGTGCCTGTATTCGAAAGAGAAGGTGGGGCTGGAAGTGAAATTGAATGCAAAGGGTTAGACATCGAGAATCAGATCAATATGGATGAGCCTCAATGTTCTGAGATTGAAATGATGGAAATGGAAACTGCTGAGACTGAGATATCGAGAATGTGCAATGATGGGAAACATGAATCTGAGGTTGTTGCCTTTAGTTCAGAGAAGTGCGAGGGAGGAAGCCATGGGAATGTGGTTTTCTCAAGAGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776847.1
METKKVPVFEREGGAGSEIECKGLDIENQINMDEPQCSEIEMMEMETAETEISRMCNDGKHESEVVAFSSEKCEGGSHGNVVFSREAPLVVKEDVSISSCSCGAEKLKSRLAASDSLPGKSGRKLSRQDRIELGRLFQGAVSSHDWELAESLILLADPQTLNDALCIALDSIWFLSTQQELYGITGLIKKIISNGAYDFTRAALRTSFLASCVSACQSRTMSLADTVSVMAQRLHERLQECNGDEVLKAEAGAKVQKFTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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