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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003730`

染色体: Chr01 坐标: 55602590-55603216 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003730`
名称	SmilChr01G003730
描述	mitochondrial import receptor subunit TOM9-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55602590 - 55603216 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995593`
GeneID	`130995593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995593`
原始查询	`SmilChr01G003730`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial import receptor subunit TOM9-2-like
产物	mitochondrial import receptor subunit TOM9-2-like
Arabidopsis	`AT5G43970` (TOM22-V) translocase of outer membrane 22-V [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834420] identity=62.9; qcov=0.927; evalue=4.02e-30; confidence=medium
Rice	`Os02g0496900` - identity=56.7; qcov=0.698; evalue=7.63e-19; confidence=low
GO	GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF04281 (Tom22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776934.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057776934.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057776934.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057776934.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55602804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B139,B20,C25
`Chr1:55602807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B139,B20,C25
`Chr1:55602827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B139,B20,C25
`Chr1:55602845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B95
`Chr1:55602863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B56,B73,C87
`Chr1:55602878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B38,B8
`Chr1:55602884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C17
`Chr1:55602891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr1:55602898`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A16,B45,B52
`Chr1:55602898`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A16,B45,B52
`Chr1:55602920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B122,B28,B65,B92
`Chr1:55602928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B110,B122,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776934.1

96 aa

Tom22

PF04281 Tom22 35-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776934.1`	Pfam	`PF04281`	Tom22	Family	35	80	1.7e-07	31.9	Mitochondrial import receptor subunit Tom22

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920951.1
ATGATATATATAGTGCGATATATTTTTTTCTTTTTTAATTAAAAAAAAAAAAGGAATTGAATAATGAAACAAGGTTTAAAGCGTTGCGAAGGGGTTTAGATCCAAACAGAAGCGCCCACCCAAAATCTTCCATGGCCTCCAAACGCCCATCTAAGAGCAGCGACGATGGAATCTTATCGCGAATCTCCGATCACTCCATCGTGCGGAAGGGGAAGAGCGCCGCCTGCGACGCCAAGTACGTGGCCATGCGCCTCCTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995593
ATGGCCTCCAAACGCCCATCTAAGAGCAGCGACGATGGAATCTTATCGCGAATCTCCGATCACTCCATCGTGCGGAAGGGGAAGAGCGCCGCCTGCGACGCCAAGTACGTGGCCATGCGCCTCCTCAAGAGCACTGGCAAGGCCGCCTGGATCCTCGGCACCACCGTCATCATCCTAGGGATCCCGCTCATCATCGAGATGGATCGCGAGGCGCAGTTCAACGAGGCCGAGCTACAGCAAGCCTCCCTCCTCGGCGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776934.1
MASKRPSKSSDDGILSRISDHSIVRKGKSAACDAKYVAMRLLKSTGKAAWILGTTVIILGIPLIIEMDREAQFNEAELQQASLLGGAAPGFMPPPQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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