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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003742`

染色体: Chr01 坐标: 55722434-55729003 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003742`
名称	SmilChr01G003742
描述	la-related protein 6B
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55722434 - 55729003 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996110`
GeneID	`130996110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996110`
原始查询	`SmilChr01G003742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 6B
产物	la-related protein 6B
Arabidopsis	`AT2G43970` (LARP6b) RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819002] identity=57.1; qcov=0.545; evalue=6.77e-84; confidence=medium
Rice	`Os11g0248200` - identity=55.5; qcov=0.52; evalue=9.41e-78; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005844 (GO:0005844); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777614.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777614.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057777614.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057777614.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55722786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B62
`Chr1:55722910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:55723401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:55723852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B33,B77
`Chr1:55728587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:55728631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B130,B137,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777614.1

440 aa

220

440

RRM_1

PF05383 La 119-176 aa PF00076 RRM_1 212-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777614.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	119	176	2.7e-18	66.3	La domain
`XP_057777614.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	212	280	3e-08	34.1	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921631.1
AATTATATGTCTCTCAGATAAAACGTAACGTACCTCTCCACATATATAAGTATATATATTTGGCCTCCATTCCCAAAACCCGAAAACTTGTGTGATTTGTCTCTCTCCACTCCAGTCTACTCCTCTTCTCGCTCTTCCCTGTCGAAAGATTTTCACTTCTCTCTCTCTACAGAGTAAGAGAGAGAATATCCAATTCAATTTAGTTGATCTGCAGATCATCCGACCATTCCGAGGACTCGATACTCCTACTCCGCATTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996110
ATGGATCAGGAGCAGGCTTCTGAAGCCCTAAATTCACCATCCGCTGCCGTCGGCAAAAAGCTCAACGCCAAGGCTCCTGAATTCGTCCCCCGCGCCTCCGCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCACCACCTCCGCCGTCGCCGCTGCTTCAACCTATGTACGCGAGGCCGCCGTCTTTTGTGCCGCCTCTGCCGCCGCCTTACTTTGGATACGAGGCCTATTACCAGCAAGATGCGGCGCCGTTCTATGCGTATAATGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777614.1
MDQEQASEALNSPSAAVGKKLNAKAPEFVPRASASSSAAAAPPPPSPLLQPMYARPPSFVPPLPPPYFGYEAYYQQDAAPFYAYNVNPGGRGEHSADGNIGSSAASSAKNGLSDAHQKVVNQVEFYFSDINLATTDQLFRFMSKDPEGYVPLSVVASFKKVKSAITDNTQLASILRSSNKLLVSEDGNNVKRQHPLTESDMEELQSRIVIAENLPEDHSHQKLMKIFSSVGSVKSIRTCAPQNLNGKTGKGDRSHFAGKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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