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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003748`

染色体: Chr01 坐标: 55802529-55803993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003748`
名称	SmilChr01G003748
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55802529 - 55803993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996125`
GeneID	`130996125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996125`
原始查询	`SmilChr01G003748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=32.1; qcov=1.02; evalue=2.19e-67; confidence=low
Rice	`Os04g0664600` (AHT1) - identity=27.7; qcov=1.08; evalue=1.22e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777617.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777617.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777617.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777617.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777617.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55802730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:55802762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B78,C36
`Chr1:55802898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C59,C84
`Chr1:55802968`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B89,C34,D8
`Chr1:55802968`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B89,C34,D8
`Chr1:55802972`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C53
`Chr1:55802972`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C53
`Chr1:55802996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:55803049`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr1:55803049`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr1:55803134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:55803188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B40,C17,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777617.1

426 aa

213

426

Transferase

PF02458 Transferase 1-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777617.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	419	1.2e-54	186.4	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921634.1
GTGGAGCTCAATATCCACATCTGAAGTCTTTCACGGTTTCATAATCATAAAAATAAAGCAAGAATGAAAGTAGAGGTGAAGAGCCGAAATTTAGTGAAACCGGCAACAGCAACCCCCTCCCACCTCCGCCTCTACAAAATCTCCATGATCGACGACCTCAATCCTCCCATCCATGTCATCCGCATCCTCTACTACCCTCCCCATTCCCCCACTCTCAACCTCGAGCCCTCACTCGCTCAAATCCTCCCCGCATTCTACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996125
ATGAAAGTAGAGGTGAAGAGCCGAAATTTAGTGAAACCGGCAACAGCAACCCCCTCCCACCTCCGCCTCTACAAAATCTCCATGATCGACGACCTCAATCCTCCCATCCATGTCATCCGCATCCTCTACTACCCTCCCCATTCCCCCACTCTCAACCTCGAGCCCTCACTCGCTCAAATCCTCCCCGCATTCTACCCCCTCGCCGGCCGCTACCTCAAACACCTCCACGCCGTCGACTGCAACGACGCCGGCGCCCATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777617.1
MKVEVKSRNLVKPATATPSHLRLYKISMIDDLNPPIHVIRILYYPPHSPTLNLEPSLAQILPAFYPLAGRYLKHLHAVDCNDAGAHFSHALVHSHLHHLLSDRAFPTSRLNALLPVAIAAADGPADPMLAVQINTFLCGGVALAVCASHRIFDACSLNIFLAAWANAATGGQLTMRPDFSSPALFPSESADPLEFGVGERRIVGRRIVFDKNAISRLRAHADLDGGKTPSRVVAVSTALTQALLRADTDKREHEGGPARA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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