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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003777`

染色体: Chr01 坐标: 56166138-56173198 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003777`
名称	SmilChr01G003777
描述	uncharacterized SmilChr01G003777
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56166138 - 56173198 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995696`
GeneID	`130995696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995696`
原始查询	`SmilChr01G003777`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0608400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0608400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G59820` (LETM1) LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825151] identity=66.5; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0608400` - identity=69; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0030003 (intracellular monoatomic cation homeostasis); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF07766 (LETM1_RBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777070.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057777070.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057777070.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777070.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56167566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:56167699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A20,A22,A4,B103,B104,B113,B114,B118,B119,B120,B127,B128,B129,B135,B18,B19,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B45,B49,B53,B54,B59,B6,B60,B62,B64,B82,B83,B9,B94,B98,B99,C1,C10,C12,C17,C19,C2,C20,C22,C34,C38,C40,C44,C47,C53,C57,C58,C59,C71,C73,C74,C76,C80,C81,C83,C86,D1,D3,D4,D6,D8,D9
`Chr1:56167856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:56167871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr1:56167947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr1:56167960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B82
`Chr1:56169080`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,B78
`Chr1:56169080`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B78
`Chr1:56169083`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B12,B78
`Chr1:56169083`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B12,B78
`Chr1:56169478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C74,C8,D4
`Chr1:56172166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B20,B40,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777070.1

729 aa

364

729

LETM1_RBD

PF07766 LETM1_RBD 244-477 aa

XP_057777078.1

729 aa

364

729

LETM1_RBD

PF07766 LETM1_RBD 244-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777070.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	244	477	3.3e-86	289.3	LETM1-like, RBD
`XP_057777078.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	244	477	3.3e-86	289.3	LETM1-like, RBD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921087.1
GCCGTTTAGTTAAAAACCTTGGGGCTGTATTTGTAATTTACGATAAAGATAAGGGGGGAAATCATATGTATGAAAAGTGGGGTGACCTAAATGTAATTATTAAACATCTCTACTTCCCTTCAGCGCAGCGCCTTCGTCAGCACTCCAAAACCTCCCTAAAACCCCTCAATCTGATCACCCCCTCCGCAAGAAAGAAGAGGCACACATGCATCTATAACTATATGATTTGGATATAATTCGCAAGTCTATACATTTTTTCT...

XM_057921095.1
GGGCTGTATTTGTAATTTACGATAAAGATAAGGGGGGAAATCATATGTATGAAAAGTGGGGTGACCTAAATGTAATTATTAAACATCTCTACTTCCCTTCAGCGCAGCGCCTTCGTCAGCACTCCAAAACCTCCCTAAAACCCCTCAATCTGATCACCCCCTCCGCAAGAAAGAAGAGGCACACATGCATCTATAACTATATGATTTGGATATAATTCGCAAGTCTATACATTTTTTCTCCACATTTTTTCATCATTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995696
ATGGCCTCTGGGGTGATTTTGAGAAGGAGAAAGACTCTTTCAGATTACTTGAGTCTCTCTCGCCTTTCTATTCAAACTTTCCATACATCTGGTTATGGTCAATCTTGTTCTCCTGGCTACACCTCCATCACAGACCACAATCTTCAAAACATAGGTCAATTGAGAGAAAATGAAAATACTTCAGCTTTGTGCAAGAAGCCATTGAATCCTGTAGCCTTAGGGATCTTTAGGCATAAAGCTTATGAAATCACAGCACCAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777070.1
MASGVILRRRKTLSDYLSLSRLSIQTFHTSGYGQSCSPGYTSITDHNLQNIGQLRENENTSALCKKPLNPVALGIFRHKAYEITAPRYGNGRSDFNCLLGARMISQSRCYASTATARKPDPGSDDKDTEEITAKRKKEASPEECDQAVAGLSTAKAKAKAKKLQESQINVKLVLKKLWATFLGIGPALRAVASMSREDWAKKLVHWKTEFVSTLKHYWLGCKLLGADVRISSRLLMKLAGGRSLSRRERQQLTRTTADVF...

XP_057777078.1
MASGVILRRRKTLSDYLSLSRLSIQTFHTSGYGQSCSPGYTSITDHNLQNIGQLRENENTSALCKKPLNPVALGIFRHKAYEITAPRYGNGRSDFNCLLGARMISQSRCYASTATARKPDPGSDDKDTEEITAKRKKEASPEECDQAVAGLSTAKAKAKAKKLQESQINVKLVLKKLWATFLGIGPALRAVASMSREDWAKKLVHWKTEFVSTLKHYWLGCKLLGADVRISSRLLMKLAGGRSLSRRERQQLTRTTADVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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