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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003786`

染色体: Chr01 坐标: 56258328-56262030 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003786`
名称	SmilChr01G003786
描述	uncharacterized SmilChr01G003786
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56258328 - 56262030 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996821`
GeneID	`130996821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996821`
原始查询	`SmilChr01G003786`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825149]; symbol=AT3G59800; hit=AT3G59800; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825149]; symbol=AT3G59800; hit=AT3G59800; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G59800` (AT3G59800) stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825149] identity=80.2; qcov=0.493; evalue=9.06e-46; confidence=medium
Rice	`Os04g0496600` - identity=84.6; qcov=0.127; evalue=5.03e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778085.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057778085.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057778085.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778085.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778085.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56260941`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B13,B56,B96,C5
`Chr1:56260941`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B13,B56,B96,C5
`Chr1:56260974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:56261173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:56261640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B108,B121,B44,B93,C21,C75
`Chr1:56261676`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B121,B25,B96,C11,C69,D11
`Chr1:56261776`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	173	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B114,B115,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B15,B18,B19,B20,B22,B23,B26,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B46,B49,B5,B54,B55,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B85,B89,B9,B90,B92,B93,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C53,C54,C57,C59,C6,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C78,C79,C80,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922102.1
CCCCCAAGGTCCCGCTTCAACTTCATTTTCATAGTATTTTTTTTATTTTTTGAATAATAAACTCCATTAGAATCTACTCAATTAGTTTCCCTCTCACACGCATCAATCTTTTCCCCTTCATATGTAGAAGAAGAAAATCGCAAAATATTTATACAAAAAATTAATGGGGAAAAATCAAGCCTACAAAGCTATGCAGAGAGGCCGGCTCGGCTCGAGCTCAGCCGGGCCGGAAGAGGTTGAGGATGGCTTGGTTGATAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996821
ATGGGGAAAAATCAAGCCTACAAAGCTATGCAGAGAGGCCGGCTCGGCTCGAGCTCAGCCGGGCCGGAAGAGGTTGAGGATGGCTTGGTTGATAGTTCATTTCATTCACCAGAGTGGCATGCTGCCCGTTTGGCAAGTCTAAAAACTTCTCATACAGTTACATGGGAGGAGTATAAAAAGAAGCAAAAGGAAGAAGAATTGAGAAAAGGAGAATTGGAAGCAGATAAAGATAGGATGATGATAGAGTATAGAGCTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778085.1
MGKNQAYKAMQRGRLGSSSAGPEEVEDGLVDSSFHSPEWHAARLASLKTSHTVTWEEYKKKQKEEELRKGELEADKDRMMIEYRAQLDAERAHKLARGSNYSSSKGSRKKDKKERDSRKHSSKKRKHSRRSSDSSSSSSLETSNTDDDEREAKRSKSRPKRGKKEKRQSSRSRSRSRSRSKQSSNGGKEADGPLPLSRFFGNLKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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