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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003793`

染色体: Chr01 坐标: 56334125-56335628 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003793`
名称	SmilChr01G003793
描述	uncharacterized SmilChr01G003793
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56334125 - 56335628 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996949`
GeneID	`130996949`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996949`
原始查询	`SmilChr01G003793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FAM136A-like protein (DUF842) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817729]; symbol=AT2G31725; hit=AT2G31725; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FAM136A-like protein (DUF842) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817729]; symbol=AT2G31725; hit=AT2G31725; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G31725` (AT2G31725) FAM136A-like protein (DUF842) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817729] identity=66.2; qcov=0.993; evalue=4.82e-70; confidence=high
Rice	`Os11g0256200` - identity=65.1; qcov=1; evalue=2.49e-69; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF05811 (DUF842)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996949

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778222.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057778222.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057778222.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057778222.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778222.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56335257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:56335290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A5,B124,C61,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778222.1

149 aa

149

DUF842

PF05811 DUF842 20-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778222.1`	Pfam	`PF05811`	DUF842	Family	20	144	6.1e-38	130.2	Eukaryotic protein of unknown function (DUF842)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922239.1
CCATTTTATCCGGGACCCTCGCCCAAGAAACCATAGGGAATTTGTTGAGCTTCCTATAAACCCTTAAACCCCTAATTCCGAATTCCGAATTCATCGGAAAAGTAACAAGCATGGATCACATAGCTGCAGCGGAAGAGGCAATGGTGAATGAAAGGTTGAGACGGAAGCTCAACGAGGTCAACGCCGCTGCCCAGCAACATCTCGCCGCCGTCCAGGACCACATTAATTTCACCCTTCAGCAATCGTACTTCAAGTGCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996949
ATGGATCACATAGCTGCAGCGGAAGAGGCAATGGTGAATGAAAGGTTGAGACGGAAGCTCAACGAGGTCAACGCCGCTGCCCAGCAACATCTCGCCGCCGTCCAGGACCACATTAATTTCACCCTTCAGCAATCGTACTTCAAGTGCGCGTACGAGTGTTTCGACAGGAGGATGAAGCAGGAAGAGATAAGCAACTGCGTGGAGCATTGCAGCGTGCCCGTGCTCAAGGCCCAGAATCTCGTCGAAACCGAAATGGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778222.1
MDHIAAAEEAMVNERLRRKLNEVNAAAQQHLAAVQDHINFTLQQSYFKCAYECFDRRMKQEEISNCVEHCSVPVLKAQNLVETEMAKFQERLSRSLAVCQDKYEAAKLQTNNSTAARNDLESCVDLSVNESIDLIPHVAGRLKAYLSMD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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