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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003799`

染色体: Chr01 坐标: 56370038-56373262 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003799`
名称	SmilChr01G003799
描述	uncharacterized SmilChr01G003799
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56370038 - 56373262 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996835`
GeneID	`130996835`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996835`
原始查询	`SmilChr01G003799`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825137]; symbol=AT3G59680; hit=AT3G59680; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825137]; symbol=AT3G59680; hit=AT3G59680; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G59680` (AT3G59680) Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825137] identity=43.8; qcov=1.1; evalue=1.94e-41; confidence=medium
Rice	`Os04g0495900` - identity=45.5; qcov=0.97; evalue=2.6e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996835

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057778090.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778090.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057778090.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778090.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56370355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B47,C16,C70
`Chr1:56370393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C26
`Chr1:56370400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A4,B12,C35,C61
`Chr1:56370459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B106,B81,C6,C72,C86
`Chr1:56370459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B81,C6,C72,C86
`Chr1:56370466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C26,C71
`Chr1:56370513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C1
`Chr1:56370551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D10
`Chr1:56370556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B120
`Chr1:56370575`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	86	A10,A14,A19,A20,A21,A3,A4,A6,A8,B1,B102,B105,B109,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B134,B136,B139,B14,B15,B18,B21,B25,B30,B35,B36,B37,B39,B4,B41,B42,B43,B47,B53,B54,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B79,B82,B86,B87,B88,B90,B97,B99,C1,C18,C20,C22,C23,C25,C27,C28,C34,C38,C39,C40,C52,C56,C57,C59,C61,C62,C64,C70,C71,C75,C77,C78,C8,C80,D11,D2,D4,D6,D7
`Chr1:56370598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B2,B66
`Chr1:56370619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922107.1
CATATTTTCGAGTTACATATTAAAGTTTCATCACTCAATCAATTTATTCATTGCTCTTCTCCTCCAATGACCATCTCACTTTCTCCATCTCTCTCTTTCAATTCCTATCTCCTTTTTTTCATGCAAGATCCAAAGAACTCCCACACAAGGAGGCGATGGTATCAAAGAGCAATAGAGGCGAGCACGTTATGGAAAGCCCTCTCGAAACCAATCGATGAGTTGATCCCCATCAAAAACATCACTCTTTGGAAGACCAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996835
ATGACCATCTCACTTTCTCCATCTCTCTCTTTCAATTCCTATCTCCTTTTTTTCATGCAAGATCCAAAGAACTCCCACACAAGGAGGCGATGGTATCAAAGAGCAATAGAGGCGAGCACGTTATGGAAAGCCCTCTCGAAACCAATCGATGAGTTGATCCCCATCAAAAACATCACTCTTTGGAAGACCAGAGACATCACAACCAGCTCCAGAAAGCTGAGGAAATGCGCGTCGACGAGGGCGGCGGCGTCGTCGCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778090.1
MTISLSPSLSFNSYLLFFMQDPKNSHTRRRWYQRAIEASTLWKALSKPIDELIPIKNITLWKTRDITTSSRKLRKCASTRAAASSLSHVCLCAPISDVFQASVVAPRRPSVSYARSRSVSSEMRAPATARMSGEGRRIFRGKSLTDDVLMRRFVVDEEATRRRNEMEMIRKRSGMRIRRIGPSPLSRMVLAHNQLIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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