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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003810`

染色体: Chr01 坐标: 56475330-56477492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003810`
名称	SmilChr01G003810
描述	uncharacterized SmilChr01G003810
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56475330 - 56477492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010417`
GeneID	`131010417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010417`
原始查询	`SmilChr01G003810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TRAF-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821002]; symbol=AT3G17380; hit=AT3G17380; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TRAF-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821002]; symbol=AT3G17380; hit=AT3G17380; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G17380` (AT3G17380) TRAF-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821002] identity=39.4; qcov=1.01; evalue=5.31e-61; confidence=medium
Rice	`Os12g0489100` (OsM13) - identity=37; qcov=0.369; evalue=2.9e-17; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00917 (MATH); PF22486 (MATH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793916.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793916.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793916.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793916.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56476270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B93,C2,D4
`Chr1:56476273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C85
`Chr1:56476288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B101,B108,B117,B121,B140,B24,B44,B57,B93,C20,C75
`Chr1:56476343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B93,C2,D4
`Chr1:56476344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B93,C2,D4
`Chr1:56476950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:56477128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:56477147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793916.1

293 aa

146

293

MATH_2

MATH

MATH_2

MATH

PF22486 MATH_2 26-149 aa PF00917 MATH 32-151 aa PF22486 MATH_2 174-291 aa PF00917 MATH 179-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793916.1`	Pfam	`PF22486`	MATH_2	Domain	26	149	1.4e-56	191.2	MATH domain
`XP_057793916.1`	Pfam	`PF00917`	MATH	Domain	32	151	1.9e-21	77.2	MATH domain
`XP_057793916.1`	Pfam	`PF22486`	MATH_2	Domain	174	291	1.4e-56	191.2	MATH domain
`XP_057793916.1`	Pfam	`PF00917`	MATH	Domain	179	290	1.9e-21	77.2	MATH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937933.1
ATGAGTGACGTCTCTGCTTCCAGTGGATGTGAACGATTTTTTGAGGAAACGAGGGATGTTTCGCCTGCGAACTTGCTGGTGAAAATTGAATGTTTTTCGTTATTCTCAAAGTATGGGATTGACAAGTACGAATCCAGGACATTTGAAGCCGGAGGCTATAAATGGAAACTGATAATATATCCTGATGGTGAAAACGACTACCTTTCTGTATACTTTTCCATTGTTGATGCTGAATCCCTGCCTGAGGGGTGGGAGGTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010417
ATGAGTGACGTCTCTGCTTCCAGTGGATGTGAACGATTTTTTGAGGAAACGAGGGATGTTTCGCCTGCGAACTTGCTGGTGAAAATTGAATGTTTTTCGTTATTCTCAAAGTATGGGATTGACAAGTACGAATCCAGGACATTTGAAGCCGGAGGCTATAAATGGAAACTGATAATATATCCTGATGGTGAAAACGACTACCTTTCTGTATACTTTTCCATTGTTGATGCTGAATCCCTGCCTGAGGGGTGGGAGGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793916.1
MSDVSASSGCERFFEETRDVSPANLLVKIECFSLFSKYGIDKYESRTFEAGGYKWKLIIYPDGENDYLSVYFSIVDAESLPEGWEVNAIFAFFVHNQLMDNYLCFRGTTRRFNSVIQKRGFSKLMSKKSLMDPSKGYVVDDGCVFGAEVFVIKSQRVNECLSLVKHTSVFKREWKISGFSKLGDVWNSEEFYVGNHKWKVELYPNGETSHEKGRYVSIHLVCVGSAEFGPHQKVKAAVLMFLKSELNATHHSYNLNHWFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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