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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003815`

染色体: Chr01 坐标: 56522984-56524308 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003815`
名称	SmilChr01G003815
描述	F-box protein At2g02240-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56522984 - 56524308 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996927`
GeneID	`130996927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996927`
原始查询	`SmilChr01G003815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At2g02240-like
产物	F-box protein At2g02240-like
Arabidopsis	`AT1G80110` (PP2-B11) phloem protein 2-B11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844351] identity=38; qcov=0.988; evalue=1.84e-29; confidence=medium
Rice	`Os02g0812600` (OsFbox116) - identity=37.7; qcov=1.01; evalue=1.16e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14299 (PP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778189.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778189.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778189.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778189.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56523354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:56523388`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A19,B102,B133,B140,B24,B38,B39,B64,B9,B95,C43,C47,C53,C6
`Chr1:56523427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B65,B91,C57
`Chr1:56523463`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B12,B78
`Chr1:56523463`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B12,B78
`Chr1:56524095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C5
`Chr1:56524111`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A13,A14,B1,B113,B122,B123,B124,B134,B17,B18,B20,B28,B31,B34,B37,B45,B50,B8,B85,B88,C11,C14,C15,C17,C40,C47,C5,C58,C59,C63,C64,C65,C69,C74,C83,D11,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778189.1

166 aa

166

PP2

PF14299 PP2 3-165 aa

XP_057778197.1

165 aa

165

PP2

PF14299 PP2 2-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778189.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	3	165	4.3e-43	147.6	Phloem protein 2
`XP_057778197.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	2	164	6e-43	147.1	Phloem protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922214.1
AGATTTCAGGTTTAATTTATACAGTAAAACACCCACTAAATTAAGAGACCTTTTGAGATAGGAACAACAAAAATGAGCTTCTGGATAGCAGCAAGGGAGCTTTCAATAACATGGAGTGAGGATCCACAGTACTGGAATTGGATTCGTCTTGATTCTTGCAGTTCGGAGGTGGCTGAGCTAGTAAGAAGCTGCTGGGTGGAAATAATCGGAAAAGTAGACGTAAGAAGTCTGCGGGTGAAGACAAGTTACAGCGCATATCT...

XM_057922206.1
ATGCAGAGCTTCTGGATAGCAGCAAGGGAGCTTTCAATAACATGGAGTGAGGATCCACAGTACTGGAATTGGATTCGTCTTGATTCTTGCAGTTCGGAGGTGGCTGAGCTAGTAAGAAGCTGCTGGGTGGAAATAATCGGAAAAGTAGACGTAAGAAGTCTGCGGGTGAAGACAAGTTACAGCGCATATCTAGTGTTCAAGCTGCAAGAAGGGTGCAAGGAGATGGAGAAGGCGACTGCATCGGTGAGGTTGGTGAAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996927
ATGAGCTTCTGGATAGCAGCAAGGGAGCTTTCAATAACATGGAGTGAGGATCCACAGTACTGGAATTGGATTCGTCTTGATTCTTGCAGTTCGGAGGTGGCTGAGCTAGTAAGAAGCTGCTGGGTGGAAATAATCGGAAAAGTAGACGTAAGAAGTCTGCGGGTGAAGACAAGTTACAGCGCATATCTAGTGTTCAAGCTGCAAGAAGGGTGCAAGGAGATGGAGAAGGCGACTGCATCGGTGAGGTTGGTGAAAGAGAT...

LOC130996927
ATGCAGAGCTTCTGGATAGCAGCAAGGGAGCTTTCAATAACATGGAGTGAGGATCCACAGTACTGGAATTGGATTCGTCTTGATTCTTGCAGTTCGGAGGTGGCTGAGCTAGTAAGAAGCTGCTGGGTGGAAATAATCGGAAAAGTAGACGTAAGAAGTCTGCGGGTGAAGACAAGTTACAGCGCATATCTAGTGTTCAAGCTGCAAGAAGGGTGCAAGGAGATGGAGAAGGCGACTGCATCGGTGAGGTTGGTGAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778189.1
MQSFWIAARELSITWSEDPQYWNWIRLDSCSSEVAELVRSCWVEIIGKVDVRSLRVKTSYSAYLVFKLQEGCKEMEKATASVRLVKEIREGSGDEGYGVFIDTTACDAEERGRFPHCRSDGWMEIKLGEFFNNLGDDGQLEMRLIEKNNPNWKTGLLVRGIDIRPN

XP_057778197.1
MSFWIAARELSITWSEDPQYWNWIRLDSCSSEVAELVRSCWVEIIGKVDVRSLRVKTSYSAYLVFKLQEGCKEMEKATASVRLVKEIREGSGDEGYGVFIDTTACDAEERGRFPHCRSDGWMEIKLGEFFNNLGDDGQLEMRLIEKNNPNWKTGLLVRGIDIRPN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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