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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003824`

染色体: Chr01 坐标: 56571041-56574573 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003824`
名称	SmilChr01G003824
描述	uncharacterized SmilChr01G003824
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56571041 - 56574573 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995846`
GeneID	`130995846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995846`
原始查询	`SmilChr01G003824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0264500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0264500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G67550` (AT5G67550) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836891] identity=28; qcov=0.975; evalue=2.65e-63; confidence=low
Rice	`Os11g0264500` - identity=41.4; qcov=0.61; evalue=9.96e-76; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF29008 (DDB_G0292058_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777277.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057777277.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057777277.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777277.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56572299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:56573139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:56573550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:56574128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C44
`Chr1:56574189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:56574254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777277.1

523 aa

262

523

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

XP_057777284.1

523 aa

262

523

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

XP_057777291.1

523 aa

262

523

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

XP_057777301.1

523 aa

262

523

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777277.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.2e-15	56.7	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057777284.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.2e-15	56.7	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057777291.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.2e-15	56.7	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057777301.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.2e-15	56.7	DDB_G0292058-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921318.1
ATTTATTCATATATATATATATCTTCCTACCTATTAATTAAACCCAAACCTCCTTTAACCCGTTTCTTTCTGAAAATACAAGCTAGGATTCCTACTCCGAACTGGATAACAAGAAATTATCACAAGACTTCATTAATAATCGAAGACGCGAATTAAATTTGGTTTCACCAAGCAAATCCAAATCCAAAGACGCAAGAGGAAAAGAAGTAGAAGTGTTAATTTGTTTTTCACACAGGTTGAAGATATGGTCTCTATAGGTG...

XM_057921301.1
CCTACCTATTAATTAAACCCAAACCTCCTTTAACCCGTTTCTTTCTGAAAATACAAGCTAGGATTCCTACTCCGAACTGGATAACAAGAAATTATCACAAGACTTCATTAATAATCGAAGACGCGAATTAAATTTGGTTTCACCAAGCAAATCCAAATCCAAAGACGCAAGAGGAAAAGAAGTAGAAGTGTTAATTTGTTTTTCACAGTTGAAGATATGGTCTCTATAGGTGGCGGCTCGTCCATGGCAACAATCCTACT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130995846
ATGGTCTCTATAGGTGGCGGCTCGTCCATGGCAACAATCCTACTTATCGTCACCATTAGCATGGCCTTAAACTTCACCTTGCTTGCAGCCCTACCAATCTTGTCAAGCAGCTCACAATCAGGGAGATTATTAGCTGAAACGAGTAACGGATCAAACTTGGATGATACCGTGAGAGTAGACCCTTTGGATGGTTTCAAGAAATACAGAGGAGGGTATGATATAACAGACAAAAACTATTGGAGTTCGACTGCATTCACAGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057777277.1
MVSIGGGSSMATILLIVTISMALNFTLLAALPILSSSSQSGRLLAETSNGSNLDDTVRVDPLDGFKKYRGGYDITDKNYWSSTAFTGIYGYSIAAVWLLCGVLYGGFLLVRSCCLKGRRNLKKKRQLCHKNCYVLPLLLAVVFTLLAILGIGLALGGNAKFHARAKTVIDIIIDTADEASDTIYNTTGAMREMSITLEAVDADPEATRFLSETSQRLDAQANDIARQASKNRRLIDKVLKIVYIITTVTVSLTLVAVIAL...

XP_057777284.1
MVSIGGGSSMATILLIVTISMALNFTLLAALPILSSSSQSGRLLAETSNGSNLDDTVRVDPLDGFKKYRGGYDITDKNYWSSTAFTGIYGYSIAAVWLLCGVLYGGFLLVRSCCLKGRRNLKKKRQLCHKNCYVLPLLLAVVFTLLAILGIGLALGGNAKFHARAKTVIDIIIDTADEASDTIYNTTGAMREMSITLEAVDADPEATRFLSETSQRLDAQANDIARQASKNRRLIDKVLKIVYIITTVTVSLTLVAVIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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