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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003827`

染色体: Chr01 坐标: 56599963-56601798 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003827`
名称	SmilChr01G003827
描述	60S ribosomal protein L38-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56599963 - 56601798 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997005`
GeneID	`130997005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997005`
原始查询	`SmilChr01G003827`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L38-like
产物	60S ribosomal protein L38-like
Arabidopsis	`AT2G43460` (AT2G43460) Ribosomal L38e protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818947] identity=94.2; qcov=1; evalue=7.9e-43; confidence=medium
Rice	`Os07g0546700` (OJ1612_A04.113) - identity=85.5; qcov=1; evalue=6.35e-40; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022618 (protein-RNA complex assembly); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01781 (Ribosomal_L38e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778270.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057778270.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778270.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778270.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778270.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778270.1

69 aa

Ribosomal_L38e

PF01781 Ribosomal_L38e 1-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778270.1`	Pfam	`PF01781`	Ribosomal_L38e	Domain	1	66	6.5e-36	122.8	Ribosomal L38e protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922287.1
CAACTTGCTAATGAATTTAAGCCCATTAGGGCTTTAGATCGCAATTGACGTACGTATAAATCTACATTTGTTCAGAACAGCGCCTCAGGGTTTGGAGCTTGCTCGTCGGTCTGCACGATTCCATCTGCTAAAATGCCGAAGCAGATTCATGAGATAAAGGATTTCCTTCTGACAGCTAGAAGGAAGGATGCACGTTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGAGGTGGTTAAGTTCAAGGTTAGGTGCTCAAAGTACTTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997005
ATGCCGAAGCAGATTCATGAGATAAAGGATTTCCTTCTGACAGCTAGAAGGAAGGATGCACGTTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGAGGTGGTTAAGTTCAAGGTTAGGTGCTCAAAGTACTTGTACACCCTCTGTGTGTTTGATCCGGAGAAAGCTGACAAATTGAAGCAGTCCCTTCCTCCTGGTTTAAGTGTGCAAGACCTGTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778270.1
MPKQIHEIKDFLLTARRKDARSVKIKRSKEVVKFKVRCSKYLYTLCVFDPEKADKLKQSLPPGLSVQDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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