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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003838`

染色体: Chr01 坐标: 56729916-56733439 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003838`
名称	SmilChr01G003838
描述	uncharacterized SmilChr01G003838
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56729916 - 56733439 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995811`
GeneID	`130995811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995811`
原始查询	`SmilChr01G003838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0264500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0264500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G67550` (AT5G67550) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836891] identity=28; qcov=0.97; evalue=2.59e-63; confidence=low
Rice	`Os11g0264500` - identity=41.4; qcov=0.606; evalue=1.16e-75; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF29008 (DDB_G0292058_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777237.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057777237.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057777237.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777237.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56730206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:56730245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr1:56730949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:56731364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B4,C36
`Chr1:56731554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C74,D4
`Chr1:56731590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:56731626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777237.1

526 aa

263

526

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

XP_057777244.1

526 aa

263

526

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

XP_057777253.1

526 aa

263

526

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

XP_057777262.1

526 aa

263

526

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 97-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777237.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.3e-15	56.6	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057777244.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.3e-15	56.6	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057777253.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.3e-15	56.6	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057777262.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	97	363	3.3e-15	56.6	DDB_G0292058-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921261.1
TTATTCATATATATTTTCCTACCTATTAAACCCAAACCTCCTTTAACCCGTTTCTTTCTGAAAATACAAGCTAGGATTCCTACTCCGAACTGGATAACAAGAAATTATCATTAATACTCGAAGACGCGAATTAAATTTGGTTTCACCAAGCAAATCCAAATCCAAAGACGCAAGAGGAAAAGAAGTAGAAGTGTTAATTTGTTTTTCACAGTTGAAGATATGGTCTCTATAGGTGGCGGCTCGTCCATGGCAACAATCCT...

XM_057921254.1
TTATTCATATATATTTTCCTACCTATTAAACCCAAACCTCCTTTAACCCGTTTCTTTCTGAAAATACAAGCTAGGATTCCTACTCCGAACTGGATAACAAGAAATTATCATTAATACTCGAAGACGCGAATTAAATTTGGTTTCACCAAGCAAATCCAAATCCAAAGACGCAAGAGGAAAAGAAGTAGAAGTGTTAATTTGTTTTTCACACAGGTTGAAGATATGGTCTCTATAGGTGGCGGCTCGTCCATGGCAACAAT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130995811
ATGGTCTCTATAGGTGGCGGCTCGTCCATGGCAACAATCCTACTTATCGTCACCATTAGCATGGCCTTAAACTTCACCTTGCTTGCAGCCCTACCAATCTTGTCAAGCAGCTCACAATCAGGGAGATTATTAGCTGAAACGAGTAACGGATCAAACTTGGATGATACCGTGAGAGTAGACCCTTTGGATGGTTTCAAGAAATACAGAGGAGGGTATGATATAACAGACAAAAACTATTGGAGTTCGACTGCATTCACAGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057777237.1
MVSIGGGSSMATILLIVTISMALNFTLLAALPILSSSSQSGRLLAETSNGSNLDDTVRVDPLDGFKKYRGGYDITDKNYWSSTAFTGIYGYSIAAVWLLCGVLYGGFLLVRSCCLKGRRNLKKKRQLCHKNCYVLPLLLAVVFTLLAILGIGLALGGNAKFHARAKTVIDIIIDTADEASDTIYNTTGAMREMSITLEAVDADPEATRFLSETSQRLDAQANDIARQASKNRRLIDKVLKIVYIITTVTVSLTLVAVIAL...

XP_057777244.1
MVSIGGGSSMATILLIVTISMALNFTLLAALPILSSSSQSGRLLAETSNGSNLDDTVRVDPLDGFKKYRGGYDITDKNYWSSTAFTGIYGYSIAAVWLLCGVLYGGFLLVRSCCLKGRRNLKKKRQLCHKNCYVLPLLLAVVFTLLAILGIGLALGGNAKFHARAKTVIDIIIDTADEASDTIYNTTGAMREMSITLEAVDADPEATRFLSETSQRLDAQANDIARQASKNRRLIDKVLKIVYIITTVTVSLTLVAVIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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