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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003846`

染色体: Chr01 坐标: 56773403-56776852 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003846`
名称	SmilChr01G003846
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7a-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56773403 - 56776852 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996886`
GeneID	`130996886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996886`
原始查询	`SmilChr01G003846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7a-like
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7a-like
Arabidopsis	`AT5G03500` (AT5G03500) Mediator complex, subunit Med7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831822] identity=79.7; qcov=0.949; evalue=7.63e-77; confidence=high
Rice	`Os04g0661800` (OsMED7) - identity=80.4; qcov=0.981; evalue=2.71e-72; confidence=high
GO	GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex); GO:0070847 (core mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF05983 (Med7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778150.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057778150.1`
3	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057778156.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057778156.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057778156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56776287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778150.1

178 aa

178

Med7

PF05983 Med7 4-149 aa

XP_057778156.1

168 aa

168

Med7

PF05983 Med7 4-158 aa

XP_057778157.1

156 aa

156

Med7

PF05983 Med7 4-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778150.1`	Pfam	`PF05983`	Med7	Family	4	149	6.4e-43	147.8	MED7 protein
`XP_057778156.1`	Pfam	`PF05983`	Med7	Family	4	158	1.4e-44	153.3	MED7 protein
`XP_057778157.1`	Pfam	`PF05983`	Med7	Family	4	150	2.4e-43	149.2	MED7 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922173.1
GTTATAAAATGACATTTTCTGTGTGTAGAAAAGTGAAAATTCACGAAAAAAATACTCCTCTTCACTTCAGTGACAGTAATTGCCGATCGTCTCTCTCAGATCCTTCTTCGTTCTCTCGCTAGCATTCCTCTCCGACAATACGATGGCAACGGCGACTTATCCACCGCCCCCGCCGTATTACAGGCTCTACAAAAACTATTCCGAGGATCCCGATTCCTGCCCCGCGCCGCCGCCTCCTATTCAGGGCCCCTACCTCCTCT...

XM_057922167.1
AAAGTGAAAATTCACGAAAAAAATACTCCTCTTCACTTCAGTGACAGTAATTGCCGATCGTCTCTCTCAGATCCTTCTTCGTTCTCTCGCTAGCATTCCTCTCCGACAATACGATGGCAACGGCGACTTATCCACCGCCCCCGCCGTATTACAGGCTCTACAAAAACTATTCCGAGGATCCCGATTCCTGCCCCGCGCCGCCGCCTCCTATTCAGGGCCCCTACCTCCTCTATGGCGCCAGCTACACGACGGATGATGTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996886
ATGGCAACGGCGACTTATCCACCGCCCCCGCCGTATTACAGGCTCTACAAAAACTATTCCGAGGATCCCGATTCCTGCCCCGCGCCGCCGCCTCCTATTCAGGGCCCCTACCTCCTCTATGGCGCCAGCTACACGACGGATGATGTCCTTCCAGGTCTAGAAGAACAGGGTGTTCGTCAGTTGTACCCTAAAGGGCCCAATATCGATTTCAAGAAAGAGCTCAGGTCTCTTAACAGGGAATTGCAGTTAAATATTTTGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778150.1
MATATYPPPPPYYRLYKNYSEDPDSCPAPPPPIQGPYLLYGASYTTDDVLPGLEEQGVRQLYPKGPNIDFKKELRSLNRELQLNILELADVLVERPSQYARRVEDISLIFKNLYHLLNSLRPHQARATLIHILELQIQRRKQAVEDIKSFMCLPLFTNEVWLAVVRKLSLCNMLLPIL

XP_057778156.1
MATATYPPPPPYYRLYKNYSEDPDSCPAPPPPIQGPYLLYGASYTTDDVLPGLEEQGVRQLYPKGPNIDFKKELRSLNRELQLNILELADVLVERPSQYARRVEDISLIFKNLYHLLNSLRPHQARATLIHILELQIQRRKQAVEDIKRRREEAQRLLTEALGTLDGQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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