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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003853`

染色体: Chr01 坐标: 56802521-56806254 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003853`
名称	SmilChr01G003853
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP16-3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56802521 - 56806254 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996813`
GeneID	`130996813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996813`
原始查询	`SmilChr01G003853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP16-3, chloroplastic-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP16-3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G43560` (AT2G43560) FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818958] identity=70.3; qcov=1.02; evalue=8.9e-103; confidence=high
Rice	`Os08g0541400` (OsFKBP16-3) - identity=80.9; qcov=0.769; evalue=2.2e-92; confidence=high
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778079.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057778079.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057778079.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778079.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778079.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56804563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B117,B140,B44
`Chr1:56805315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D4
`Chr1:56805536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A3,B49,C25
`Chr1:56805542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C44
`Chr1:56805549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B25,C46,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778079.1

225 aa

112

225

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 123-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778079.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	123	215	6e-21	75.3	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922096.1
GAGAAATCCTAATGTTCGTTATACGTCATCCACATAAAGATGCAAACAACTGATAACAGACTATTCACCACCATTTGCACAAGGAAAACCAAATGGCATCACCATCTTTGTTACTTCCACTCGGTTGTATATTTGGAAAGAGTAATGCCTCCAATCATCAAAGAGCACACAAAATCAGTGCTGGTGCCTTAGCATCAGAACCTAGTTTACAAGTGTCAAACATCAGTGACCGTCGAGATGAGTGTGCTGTCATGAACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996813
ATGGCATCACCATCTTTGTTACTTCCACTCGGTTGTATATTTGGAAAGAGTAATGCCTCCAATCATCAAAGAGCACACAAAATCAGTGCTGGTGCCTTAGCATCAGAACCTAGTTTACAAGTGTCAAACATCAGTGACCGTCGAGATGAGTGTGCTGTCATGAACCGCAGAAACATGATCAATGTCGGAGTCGGGCTTCTAGGACTCCTGAGCGGCACTACTTTGGCCGAAGCAGCTGGATTGCCTCCGGAGGACAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778079.1
MASPSLLLPLGCIFGKSNASNHQRAHKISAGALASEPSLQVSNISDRRDECAVMNRRNMINVGVGLLGLLSGTTLAEAAGLPPEDKPKLCDGACEKELENVPMVTTESGLQYKDIKVGGGPSPPIGFQVAANYVAMVPSGQIFDSSLEKGQVYIFRVGSGQVIKGLDEGILSMKVGGKRRLYIPGPLAFPKGLASAPGRPRVAANSPVIFDVSLLFIPGLDDEEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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