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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003871`

染色体: Chr01 坐标: 56957939-56961038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003871`
名称	SmilChr01G003871
描述	uncharacterized SmilChr01G003871
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56957939 - 56961038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997470`
GeneID	`130997470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997470`
原始查询	`SmilChr01G003871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRFPV-7; symbol=OsRFPV-7; hit=Os01g0894600; species=rice; confidence=high
产物	OsRFPV-7; symbol=OsRFPV-7; hit=Os01g0894600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G02960` (AT2G02960) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814825] identity=47.5; qcov=0.742; evalue=2.26e-44; confidence=medium
Rice	`Os01g0894600` (OsRFPV-7) - identity=50.6; qcov=0.73; evalue=1.32e-55; confidence=high
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF12428 (DUF3675); PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057778769.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057778769.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057778769.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057778769.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778769.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56960204`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr1:56960204`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr1:56960399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B67,C21,C31,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778769.1

251 aa

126

251

RINGv

DUF3675

PF12906 RINGv 71-116 aa PF12428 DUF3675 122-239 aa

XP_057778777.1

244 aa

122

244

RINGv

DUF3675

PF12906 RINGv 71-116 aa PF12428 DUF3675 122-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778769.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	71	116	5.9e-14	52.7	RING-variant domain
`XP_057778769.1`	Pfam	`PF12428`	DUF3675	Family	122	239	3.5e-27	96.0	Protein of unknown function (DUF3675)
`XP_057778777.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	71	116	5.5e-14	52.7	RING-variant domain
`XP_057778777.1`	Pfam	`PF12428`	DUF3675	Family	122	232	5.5e-25	88.9	Protein of unknown function (DUF3675)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922794.1
CTCTTACATCTCTCTCTCTACATACATACAATTTCTCTAAAACTTCATCATCATCATCATCATCCACTTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATATGGTGGATGAATTAATGGTGGTGTGCGTGGACAGGATTATAGCATCAGCTGCATGCCTTCAACAACCAAATAACACTACACCAGAAAAAGAAAGTGTTGCAGTTAGTGTTGGTGGTGGAAATGATGGCGATGGTACAACAAAAGATGGGATTTTTAACGGAGGGA...

XM_057922786.1
TCTTACATCTCTCTCTCTACATACATACAATTTCTCTAAAACTTCATCATCATCATCATCATCCACTTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATATGGTGGATGAATTAATGGTGGTGTGCGTGGACAGGATTATAGCATCAGCTGCATGCCTTCAACAACCAAATAACACTACACCAGAAAAAGAAAGTGTTGCAGTTAGTGTTGGTGGTGGAAATGATGGCGATGGTACAACAAAAGATGGGATTTTTAACGGAGGGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997470
ATGGTGGATGAATTAATGGTGGTGTGCGTGGACAGGATTATAGCATCAGCTGCATGCCTTCAACAACCAAATAACACTACACCAGAAAAAGAAAGTGTTGCAGTTAGTGTTGGTGGTGGAAATGATGGCGATGGTACAACAAAAGATGGGATTTTTAACGGAGGGATTTCTTCTTCTTCTTCGACAGAAGTAAAAGGGAGAGTGAGTGAGTGCAGAATTTGTCAGGAGGAAGACCACGACAAGGATTTGGAGTCTCCTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778769.1
MVDELMVVCVDRIIASAACLQQPNNTTPEKESVAVSVGGGNDGDGTTKDGIFNGGISSSSSTEVKGRVSECRICQEEDHDKDLESPCACSGTLKFAHRKCVQRWCNKKGDITCEICNQVFSPNYICPPPRGNADVMTIDIRQAWEAHVDLHHTQLLAFTEAGHQLLQSEYNDYGMENRRILICFRSAVIILMLLLVIHQTLMVKLDIGMPLGSSVFFHYLISILQLAGFLLPCYIVAHSWYIVQYRRGRQG

XP_057778777.1
MVDELMVVCVDRIIASAACLQQPNNTTPEKESVAVSVGGGNDGDGTTKDGIFNGGISSSSSTEVKGRVSECRICQEEDHDKDLESPCACSGTLKFAHRKCVQRWCNKKGDITCEICNQVFSPNYICPPPRGNADVMTIDIRQAWEAHVDLHHTQLLAFTEAGHQLLQSEYNDYGMENRRILICFRSAVIILMLLLVIHQTLMVKLDIGMPLGSSVFFHLAGFLLPCYIVAHSWYIVQYRRGRQG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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