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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003875`

染色体: Chr01 坐标: 57023740-57024237 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003875`
名称	SmilChr01G003875
描述	uncharacterized SmilChr01G003875
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57023740 - 57024237 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010473`
GeneID	`131010473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010473`
原始查询	`SmilChr01G003875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920]; symbol=AT4G37660; hit=AT4G37660; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920]; symbol=AT4G37660; hit=AT4G37660; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G37660` (AT4G37660) Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920] identity=54.8; qcov=0.732; evalue=7.91e-34; confidence=medium
Rice	`Os02g0198900` (OsRPL7/L12) - identity=71.7; qcov=0.293; evalue=2.04e-17; confidence=weak
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00542 (Ribosomal_L12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057793998.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057793998.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793998.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793998.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57023744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:57023764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A10,A20,A25,B111,B126,B3,B44,B65,B69,B86,B98,C12,C26,C35,C54,C56,C73,C82,C87,D2
`Chr1:57023771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B89,C34,C82,C87,D8
`Chr1:57023779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B89,C34,C82,C87,D8
`Chr1:57023782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:57023806`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B114,B122,C20,C49,C5,D4
`Chr1:57023811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:57023815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:57023821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:57023839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:57023840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B21,C31
`Chr1:57023882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793998.1

157 aa

157

Ribosomal_L12

PF00542 Ribosomal_L12 92-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793998.1`	Pfam	`PF00542`	Ribosomal_L12	Domain	92	137	4.4e-15	56.5	Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938015.1
ATATCCTCAATAATTCCAAAAATCCAGTCCAGCTCCCTTGCTCGGTCGCTCTTCCACCGGCTAGCTCTCTGCACCGCCGTGGAGATTCGAACCCAAAAGCTTGAGCGAATCACCGAGGAGCTTATTGGCCTCAACAAGATCGAGCGCCATGATTACGTTACACTATTTCGTCATATTAAAATGGGCTTGAATCGGTTCGGCGTCGCTGCCTCCGCACCCGCCACCCAATCGCCTTCGACAGCCGCCCTTGCTGCCGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010473
ATATCCTCAATAATTCCAAAAATCCAGTCCAGCTCCCTTGCTCGGTCGCTCTTCCACCGGCTAGCTCTCTGCACCGCCGTGGAGATTCGAACCCAAAAGCTTGAGCGAATCACCGAGGAGCTTATTGGCCTCAACAAGATCGAGCGCCATGATTACGTTACACTATTTCGTCATATTAAAATGGGCTTGAATCGGTTCGGCGTCGCTGCCTCCGCACCCGCCACCCAATCGCCTTCGACAGCCGCCCTTGCTGCCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793998.1
ISSIIPKIQSSSLARSLFHRLALCTAVEIRTQKLERITEELIGLNKIERHDYVTLFRHIKMGLNRFGVAASAPATQSPSTAALAAAKEKTTFDVKLEKFEASAKLKVIKEIRSFTDLGLKEANDLVEKTPAVVKKDSGRASSTRCSRRSSTTPSNST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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