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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003876`

染色体: Chr01 坐标: 57029014-57033755 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003876`
名称	SmilChr01G003876
描述	extensin-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57029014 - 57033755 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997521`
GeneID	`130997521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997521`
原始查询	`SmilChr01G003876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	extensin-2-like
产物	extensin-2-like
Arabidopsis	`AT1G21310` (EXT3) extensin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838728] identity=37.4; qcov=0.482; evalue=1.3e-06; confidence=low
Rice	`Os01g0899700` - identity=41.7; qcov=0.29; evalue=1.15e-41; confidence=weak
GO	GO:0005199 (structural constituent of cell wall); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF04554 (Extensin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057778843.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057778843.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778843.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778843.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57029135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:57029202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B89,C34,C82,C87,D8
`Chr1:57029237`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr1:57029237`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr1:57029246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr1:57029263`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B131
`Chr1:57029263`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B131
`Chr1:57029314`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr1:57029314`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B55
`Chr1:57029407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:57029880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:57029885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778843.1

909 aa

454

909

Extensin_2

PF04554 Extensin_2 32-67 aa PF04554 Extensin_2 824-873 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778843.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	32	67	1.1e-26	93.3	Extensin-like region
`XP_057778843.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	824	873	1.1e-26	93.3	Extensin-like region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922860.1
TTTCAATCATCTCTTCTCTTCTCTCTTCTCCCAACAAACTAACCTTGAATAGAATTAATTTCCCTCCGGCCTCCACACATTGCCGGAGCTGGTGGCATTTTCCGGCCACATAATGACGACTCGCCGCCCTGCCAAGGGCAGGATACTGCCACAGTTCCTGCTGGTGGCATTGGCCATATTGACAACTTCTAGTATGGTGTCAGCTGATCCTTATGTATACTCTTCTCCACCTCCTCCTTATGTGTACAAGTCTCCCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997521
ATGACGACTCGCCGCCCTGCCAAGGGCAGGATACTGCCACAGTTCCTGCTGGTGGCATTGGCCATATTGACAACTTCTAGTATGGTGTCAGCTGATCCTTATGTATACTCTTCTCCACCTCCTCCTTATGTGTACAAGTCTCCCCCACCGCCGTCTCCATCTCCACCACCACCTTATGTATATAAGTCTCCACCCCCACCATCACCATCCCCTCCACCACCTTATGTATACAACTCTCCTCCACCGCCTTCTCCCTCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778843.1
MTTRRPAKGRILPQFLLVALAILTTSSMVSADPYVYSSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYNSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKTPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPLSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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