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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003885`

染色体: Chr01 坐标: 57168137-57170921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003885`
名称	SmilChr01G003885
描述	uncharacterized SmilChr01G003885
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57168137 - 57170921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997629`
GeneID	`130997629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997629`
原始查询	`SmilChr01G003885`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0299500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0299500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G59310` (AT3G59310) solute carrier family 35 protein (DUF914) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825100] identity=70.4; qcov=0.964; evalue=6.34e-157; confidence=high
Rice	`Os05g0299500` - identity=71.6; qcov=0.927; evalue=2.15e-165; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA); PF06027 (SLC35F); PF08627 (CRT-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057779002.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057779002.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057779002.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779002.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57168316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B82,C20,C5,C8
`Chr1:57168654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B82,C20,C5
`Chr1:57168903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:57169486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C20,C5
`Chr1:57169539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B138,C71,D4
`Chr1:57169541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B138,C71
`Chr1:57169586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B131,C76
`Chr1:57169598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B68,C16,C26,D7
`Chr1:57169756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:57169801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:57170066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr1:57170098`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B102,B105,B115,B118,B128,B135,B2,B20,B75,C28,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779002.1

330 aa

165

330

SLC35F

EamA

CRT-like

PF06027 SLC35F 9-299 aa PF00892 EamA 21-145 aa PF08627 CRT-like 71-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779002.1`	Pfam	`PF06027`	SLC35F	Family	9	299	1.3e-133	445.9	Solute carrier family 35
`XP_057779002.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	21	145	6.9e-14	53.0	EamA-like transporter family
`XP_057779002.1`	Pfam	`PF08627`	CRT-like	Family	71	211	2.7e-08	33.9	CRT-like, chloroquine-resistance transporter-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923019.1
TACGAGTTGTCTCGCTTCGGCTTGGCTAACTAATAGTAACACATTAATGCGCATAAAATCTGAACGAAGATGGTGAATTGCAAAAAATTGTTCACGAAATCTACATTATTAGGGCTTGCTTTAGGACAGTTTCTCTCTCTTCTCATCACCTCCACCGGATTTTCATCTTCTGAACTCGCCAACAGAGGAATTAATGCACCAACGTCGCAGTCGTTCTTGAATTATGTATTGTTGGTATTGGTCTATGGAAGCATTATGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997629
ATGGTGAATTGCAAAAAATTGTTCACGAAATCTACATTATTAGGGCTTGCTTTAGGACAGTTTCTCTCTCTTCTCATCACCTCCACCGGATTTTCATCTTCTGAACTCGCCAACAGAGGAATTAATGCACCAACGTCGCAGTCGTTCTTGAATTATGTATTGTTGGTATTGGTCTATGGAAGCATTATGCTCTACAGAAGAAAACCTCTCAAGGCCAAATGGTATTACTACATCTTGCTAGGATTGGTTGATGTTGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779002.1
MVNCKKLFTKSTLLGLALGQFLSLLITSTGFSSSELANRGINAPTSQSFLNYVLLVLVYGSIMLYRRKPLKAKWYYYILLGLVDVEANFLVVKAYQYTSLTSVMLLDCWTIPCVLFLTWFFLKTKYRFQKFIGVAICIAGLVTVVFSDVHAADRSSGSIPIKGDLLVIAGATLYGVSNVSEEFFVKSADRVELMAFLGIFGAIISAIQISILERHELKSIHWSSGATLPFVGFSLAMFAFYSGVPVLLKMNGSTMLNLSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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