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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003886`

染色体: Chr01 坐标: 57175389-57181511 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003886`
名称	SmilChr01G003886
描述	plant UBX domain-containing protein 11
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57175389 - 57181511 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997617`
GeneID	`130997617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997617`
原始查询	`SmilChr01G003886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant UBX domain-containing protein 11
产物	plant UBX domain-containing protein 11
Arabidopsis	`AT2G43210` (AT2G43210) Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818922] identity=41.9; qcov=1.07; evalue=6.57e-115; confidence=medium
Rice	`Os11g0293900` - identity=34.2; qcov=1.08; evalue=6.48e-89; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00789 (UBX); PF23187 (UBX7_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057778983.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057778983.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778990.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778983.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57176483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C59
`Chr1:57178485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:57179887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B138,B40,C71,D4
`Chr1:57179933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C59
`Chr1:57180268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:57180279`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr1:57180279`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr1:57180417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:57180804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr1:57180832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B131,C76
`Chr1:57180940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C4
`Chr1:57180971`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B122,B22,B41,B78,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778983.1

517 aa

258

517

UBX7_N

UBX

PF23187 UBX7_N 9-90 aa PF00789 UBX 288-366 aa

XP_057778990.1

508 aa

254

508

UBX7_N

UBX

PF23187 UBX7_N 9-90 aa PF00789 UBX 279-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778983.1`	Pfam	`PF23187`	UBX7_N	Domain	9	90	1.6e-10	41.8	UBX7 N-terminal domain
`XP_057778983.1`	Pfam	`PF00789`	UBX	Domain	288	366	3e-18	66.5	UBX domain
`XP_057778990.1`	Pfam	`PF23187`	UBX7_N	Domain	9	90	1.6e-10	41.8	UBX7 N-terminal domain
`XP_057778990.1`	Pfam	`PF00789`	UBX	Domain	279	357	2.9e-18	66.6	UBX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923007.1
GTGAAATGGGTGGGATTAGTAATTTGTGCAAGTTTAGGGGTAAAAATAAAATTTGTTTCAGGGTATAACAAATGGGAAAAAATCATCTGAAAATCACACAAATCGAATTCTGACTGCCTTCTCTTGCTTCTGAATCTCTCGTTTTCCGCTAAGATGGAGTACTCCCTCTCCTCTCTTGCTTTTAGAGGTTCTATAACAGAAGCAATTGCTGAATCAAAACAACAGAAGAAGCTTTTTGTTGTCTATACTGCAGGTGACAA...

XM_057923000.1
TGAAATGGGTGGGATTAGTAATTTGTGCAAGTTTAGGGGTAAAAATAAAATTTGTTTCAGGGTATAACAAATGGGAAAAAATCATCTGAAAATCACACAAATCGAATTCTGACTGCCTTCTCTTGCTTCTGAATCTCTCGTTTTCCGCTAAGATGGAGTACTCCCTCTCCTCTCTTGCTTTTAGAGGTTCTATAACAGAAGCAATTGCTGAATCAAAACAACAGAAGAAGCTTTTTGTTGTCTATACTGCAGGTGACAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997617
ATGGAGTACTCCCTCTCCTCTCTTGCTTTTAGAGGTTCTATAACAGAAGCAATTGCTGAATCAAAACAACAGAAGAAGCTTTTTGTTGTCTATACTGCAGGTGACAATCCAAACTCAAAACTCTTAGAAACATCCACATGGATTGATCCCAAAGTTTCTGAGACAGTCTCAAAGTACTGCATTTTGTTGCACATCTTGGAAGGAAGCTCTGAAGCATTGAATTTTTCAGCAATATACCCACAGCAATCTTTCCCTTGTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778983.1
MEYSLSSLAFRGSITEAIAESKQQKKLFVVYTAGDNPNSKLLETSTWIDPKVSETVSKYCILLHILEGSSEALNFSAIYPQQSFPCITAVGYNGVLLWQKEGFVHADMLASSLEKAWLSLHVQETTAAFLTAAIAKQSASGSSEVASPEQVRAGTGVPTSTTNGATPSVGAGQPLHSETKENVNSNKDASEGTYFKGDDVALPKPAIANALDNGELDESISETETGNASRNLVEIGQNNPRAALPLAEENLDGGDAHLSD...

XP_057778990.1
MEYSLSSLAFRGSITEAIAESKQQKKLFVVYTAGDNPNSKLLETSTWIDPKVSETVSKYCILLHILEGSSEALNFSAIYPQQSFPCITAVGYNGVLLWQKEGFVHADMLASSLEKAWLSLHVQETTAAFLTAAIAKQSASGSSEVASPEQVRAGTGVPTSTTNGATPSVGAGQPLHSETKENGTYFKGDDVALPKPAIANALDNGELDESISETETGNASRNLVEIGQNNPRAALPLAEENLDGGDAHLSDNREIVKEAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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