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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003889`

染色体: Chr01 坐标: 57204949-57209344 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003889`
名称	SmilChr01G003889
描述	PTI1-like tyrosine-protein kinase 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57204949 - 57209344 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997657`
GeneID	`130997657`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997657`
原始查询	`SmilChr01G003889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PTI1-like tyrosine-protein kinase 1
产物	PTI1-like tyrosine-protein kinase 1
Arabidopsis	`AT3G59350` (AT3G59350) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825104] identity=81.2; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0899000` (OsRLCK52) - identity=78.9; qcov=0.901; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004713 (protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997657

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779043.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779043.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779043.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779043.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57206626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:57207472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:57207497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:57207517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C81,D4
`Chr1:57207881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C48,D7
`Chr1:57207974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A1,A19,A6,B113,B14,B15,B26,B29,B41,B57,B69,B74,B83,B95,C19,C24,C32,C37,C55,C68,C7,C79
`Chr1:57208468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C47
`Chr1:57208506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B66
`Chr1:57208963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B138,B33,B37,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779043.1

395 aa

198

395

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 108-320 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 110-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779043.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	108	320	3.3e-39	135.6	Protein kinase domain
`XP_057779043.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	110	382	1.9e-47	162.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923060.1
TTCCCCCAAAAAACAAAATGATTGAAGATGTGAAAAAGCAGTTTATGAAGGAAGGAAGAAAATATCTGTTTGTTTTGTTTATTCGAAGCGAATGAATACACACACGAAACCAACAATTTTACGATGTGCCTTTTTCTTCAATCCACTCCACCGCCCCTTCTCACTGTTGAGCATCTCTTTGTGTCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACACACACTAACAAACACTGATATACACTAGTTTCCCCTTCATTCGTTGGTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997657
ATGGACAATCGGCATGGTTTGGCCCAGGCACCTCCTCCCGGTCACTTTGTACGCTTGGAGAACAAGAGTGCTGAAGATAATCTTTATTTGAGAAAGAGAACAAGGATGCGTAGGTGGCTGTGCTGCACTTGTCAAGTAGAGGAGTCCTATCAACCTGACGAAAATGAGCACCTCAAGAGCCCGAGGGATAATGATGGGCATCAAAGAGGCTCAAAGGTGTCTGCTCCGGTGAAACCTGAAGTTCAGAAGGCAGTACCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779043.1
MDNRHGLAQAPPPGHFVRLENKSAEDNLYLRKRTRMRRWLCCTCQVEESYQPDENEHLKSPRDNDGHQRGSKVSAPVKPEVQKAVPPIEVPSLSLEELKEKTDNFGSKALIGEGSYGRVYFAQLNDGKEVAVKKLDVSSEPDSNVEFLTQVSMVSRLKHDNLVELLGYCVDGNLRVLAYEFATMGSLHDILHGRKGVQGAQPGPTLDWMQRVRIAVDAARGLEYLHEKVQPSIIHRDIRSSNVLLFEDYKAKIADFNLSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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