当前解析结果
SmilChr01G003895| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003895 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003895 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003895 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 57238650 - 57240099 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997734 |
|---|---|
| GeneID | 130997734 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997734 |
| 原始查询 | SmilChr01G003895 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997734 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779128.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057779137.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779128.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779128.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779128.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:57238822 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr1:57238827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,C39 |
Chr1:57238832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B44,B61,B70,D7 |
Chr1:57238833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,C39 |
Chr1:57238855 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,B67,C21,C39,C60 |
Chr1:57238859 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B44 |
Chr1:57238859 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr1:57239117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr1:57239709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr1:57239716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:57239724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,B70,C28,C82 |
Chr1:57239728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。