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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003915`

染色体: Chr01 坐标: 57430136-57434206 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003915`
名称	SmilChr01G003915
描述	uncharacterized SmilChr01G003915
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57430136 - 57434206 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997954`
GeneID	`130997954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997954`
原始查询	`SmilChr01G003915`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes-like protein, putative (DUF3531) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830738]; symbol=AT5G08400; hit=AT5G08400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	structural maintenance of chromosomes-like protein, putative (DUF3531) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830738]; symbol=AT5G08400; hit=AT5G08400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G08400` (AT5G08400) structural maintenance of chromosomes-like protein, putative (DUF3531) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830738] identity=77.1; qcov=0.794; evalue=2.08e-154; confidence=high
Rice	`Os02g0827600` - identity=69; qcov=0.763; evalue=8.21e-127; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12049 (DUF3531)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057779375.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057779375.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779375.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779375.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57430493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B111,C46,C7
`Chr1:57430506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C79
`Chr1:57430723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:57430942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:57432992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C82
`Chr1:57433546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:57433603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:57433770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:57433791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779375.1

325 aa

162

325

DUF3531

PF12049 DUF3531 176-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779375.1`	Pfam	`PF12049`	DUF3531	Family	176	315	1.6e-52	177.9	Protein of unknown function (DUF3531)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923392.1
GGTGAATTTTGGGTTCAGATATTCTACAGAGGAAATAAAATGAAAACATCTTGTGCATATGCACGATGTACCTCTTTCACGAGACGGAAGGAACTTCTTTCCTCTTCATGTTCACTGTCGGCGGCCCAGTTTACCGCAGTACCCCAACATAATGTATTTCTTGCTCTTCCTGCTAGTAGGAAGCTGTGGCAACATATGCTGCTGCCTGCAGTAGCAGTGGCAAAGAAGGATGTTAGAGGGAGTGTCAATCAGGAGGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997954
ATGAAAACATCTTGTGCATATGCACGATGTACCTCTTTCACGAGACGGAAGGAACTTCTTTCCTCTTCATGTTCACTGTCGGCGGCCCAGTTTACCGCAGTACCCCAACATAATGTATTTCTTGCTCTTCCTGCTAGTAGGAAGCTGTGGCAACATATGCTGCTGCCTGCAGTAGCAGTGGCAAAGAAGGATGTTAGAGGGAGTGTCAATCAGGAGGATGACACGGAGCCCAGTACAAGCGAGGGTAGTAGTGGAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779375.1
MKTSCAYARCTSFTRRKELLSSSCSLSAAQFTAVPQHNVFLALPASRKLWQHMLLPAVAVAKKDVRGSVNQEDDTEPSTSEGSSGKFAKGSGTTARGRRLLKIREEKRKRDQERLHKYPAWAKVLEDACRNDSELRAVLGDSIGNPDLMRKRVEERVRTRGRNITKSKSGSVLAFKVSFRDFNPLDSYIWFELYGSPSDRDVDLLGSVIQSWYVMGRLGAFNTANLQLANSSMEHDPLYDADKGFKVMPSSFHDISDVEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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