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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003927`

染色体: Chr01 坐标: 57542179-57551188 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003927`
名称	SmilChr01G003927
描述	importin beta-like SAD2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57542179 - 57551188 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998050`
GeneID	`130998050`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998050`
原始查询	`SmilChr01G003927`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	importin beta-like SAD2
产物	importin beta-like SAD2
Arabidopsis	`AT2G31660` (SAD2) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817722] identity=73.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0337201` - identity=77; qcov=0.773; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005635 (nuclear envelope); GO:0005829 (cytosol); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0031267 (small GTPase binding)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03810 (IBN_N); PF08506 (Cse1); PF25758 (TPR_IPO11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998050

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779472.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057779472.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779472.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779472.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057779472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57543328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	B106,B114,B121,B126,B13,B25,B3,B33,B42,B43,B61,B67,B7,B78,B8,B9,B91,B96,B98,C14,C21,C23,C48,C54,C61,C63,C67,C7,C81,D7
`Chr1:57543343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C87
`Chr1:57543391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	B126,B129,B13,B25,B31,B42,B44,B67,B7,B78,B8,B9,C14,C19,C21,C23,C26,C54,C61,C67,C7,C87,D7
`Chr1:57543979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D7
`Chr1:57545870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:57546429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A25,C27,C49
`Chr1:57546799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:57546814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B101,B24,B82
`Chr1:57546969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B24
`Chr1:57547331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A5
`Chr1:57547475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,C26
`Chr1:57549168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779472.1

1035 aa

518

1035

IBN_N

Cse1

TPR_IPO11

PF03810 IBN_N 24-99 aa PF08506 Cse1 153-450 aa PF25758 TPR_IPO11 619-917 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779472.1`	Pfam	`PF03810`	IBN_N	Repeat	24	99	4.5e-16	59.3	Importin-beta N-terminal domain
`XP_057779472.1`	Pfam	`PF08506`	Cse1	Repeat	153	450	9.5e-11	41.9	Cse1
`XP_057779472.1`	Pfam	`PF25758`	TPR_IPO11	Repeat	619	917	1.7e-10	41.2	Importin-11-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923489.1
ACGCGCACACACATTCCTCGCTGTCCTTCCTCTCCCGGTGTCTCTCCTCGCTTGTCTCTCTCTCTCTAAACCCTAGAAAGAGAAATCAATACGAATAATTCCATCACGGAATCTTCTTCTCCTGGGGTTTAGATTTTTATTCGCCCTTCGTTTCTCCGTCCTTGTTTTGTGGCTATAGAATTGCGGGATGGATCTCCCGAGTTTGGCTTTGATCCTGCAGGGTGCACTCAGCACCAATCCTGACCAACGGAGGGCCGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998050
ATGGATCTCCCGAGTTTGGCTTTGATCCTGCAGGGTGCACTCAGCACCAATCCTGACCAACGGAGGGCCGCTGAAGAGAGTCTCAATCAGATTCAGTATGCGCCGCAGCATTTAGTGAGGCTGTTGCAGATCATAGTAGAAGTCAGCTGCGATATAGCGGTTAGACAAGTCGCTAGCATTACCTTCAAGAATTTCATTGCTAAAAATTGGGTTTCTCATGAAGCAGGCCAACAATCAAGGATCTTGCCTGAGGACAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779472.1
MDLPSLALILQGALSTNPDQRRAAEESLNQIQYAPQHLVRLLQIIVEVSCDIAVRQVASITFKNFIAKNWVSHEAGQQSRILPEDKEVVRQNILNFIAQVPPILRAQLGECLKTIVHADYPEQWPALLHWVKHNLQDQQVYGALFVLRILSRKYEFKSDDERLPVNHIVEETFPNLLNIFNRLVQVANPSIEVADLIKLICKIFWSSIYLEIPKQLFDPNVFNGWMILFLNILERPVPAEGQPEDPELRKTWGWWKVKKW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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