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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003944`

染色体: Chr01 坐标: 57771304-57775906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003944`
名称	SmilChr01G003944
描述	uncharacterized SmilChr01G003944
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57771304 - 57775906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010593`
GeneID	`131010593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010593`
原始查询	`SmilChr01G003944`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G20520` (AT4G20520) RNA binding / RNA-directed DNA polymerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827800] identity=32.1; qcov=0.13; evalue=6.38e-08; confidence=weak
Rice	`Os03g0643433` - identity=36.3; qcov=0.327; evalue=1.2e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794172.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794172.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057794172.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794172.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57771508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr1:57771601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:57772924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:57773012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:57773201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:57775125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B22,B48,C37,C62
`Chr1:57775131`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B19
`Chr1:57775131`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B19
`Chr1:57775133`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A13,A20,A23,B118,B126,B128,B131,B133,B14,B17,B23,B37,B51,B55,B69,B70,B71,B73,B87,B93,B97,B99,C16,C17,C19,C32,C35,C44,C45,C6,C67,C76,C77,D4,D9
`Chr1:57775134`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A1,A10,B1,B103,B105,B110,B114,B115,B119,B125,B129,B139,B140,B22,B24,B29,B32,B33,B36,B59,B65,B67,B7,B71,B72,B77,B80,B87,B90,B92,B95,C24,C26,C3,C30,C32,C34,C52,C64,C65,C66,C68,C73,C81,D6,D7
`Chr1:57775135`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A14,A3,A7,A8,B117,B135,B17,B25,B3,B32,B56,B59,B96,C19,C31,C41,C5,C56,C65,C72,C73,C75,D10,D9
`Chr1:57775145`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B93,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794172.1

623 aa

312

623

RVT_1

PF00078 RVT_1 316-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794172.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	316	408	5.3e-11	43.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938189.1
ATGTGTGATAAGTGGTGGGGGAGGAGTAATTTTGATTGGGCTGTGAGGGAGTCAGAAGGCAGATCGGGTGGAATACTATCGGTCTGGAACAAGGATAAGTTTGTGGCAACTAGTAAATGGAACGTGACGGGGGCTGTTATTGTTAATGGGATTTGGCTACAAGGAGGCCTGCATTGTTGTTTTGTTAATGTGTATGCGCCCATGGGAACCACCGAAAAGGAATCTTTGTGGGATACATTACAGCTCATTGCTCTTCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010593
ATGTGTGATAAGTGGTGGGGGAGGAGTAATTTTGATTGGGCTGTGAGGGAGTCAGAAGGCAGATCGGGTGGAATACTATCGGTCTGGAACAAGGATAAGTTTGTGGCAACTAGTAAATGGAACGTGACGGGGGCTGTTATTGTTAATGGGATTTGGCTACAAGGAGGCCTGCATTGTTGTTTTGTTAATGTGTATGCGCCCATGGGAACCACCGAAAAGGAATCTTTGTGGGATACATTACAGCTCATTGCTCTTCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794172.1
MCDKWWGRSNFDWAVRESEGRSGGILSVWNKDKFVATSKWNVTGAVIVNGIWLQGGLHCCFVNVYAPMGTTEKESLWDTLQLIALQNKDSCLCFLGDFNAVRDPGERVGKCAVFNQADARSFDAFIRQSNLLEIRTQGRKFTWYQPGGGCKSKLDRFMVNEKWMQEWADTVGRGLQRSVSDHYLKDELQELDIFDDTFGLEESETIRRNELRAKIFLKSKEKWLDVGGCWIEDPKTIKENVKTFFENHFKKTPRVLPMIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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