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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003949`

染色体: Chr01 坐标: 57874736-57878256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003949`
名称	SmilChr01G003949
描述	protein RER1A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57874736 - 57878256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998241`
GeneID	`130998241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998241`
原始查询	`SmilChr01G003949`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RER1A-like
产物	protein RER1A-like
Arabidopsis	`AT4G39220` (ATRER1A) Rer1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830077] identity=63.6; qcov=0.98; evalue=1.67e-91; confidence=high
Rice	`Os08g0309300` (Cen8.t00808) - identity=69.6; qcov=0.859; evalue=1.3e-79; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF03248 (Rer1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057779658.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057779658.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057779658.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057779663.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779658.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57874924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:57875001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B24
`Chr1:57875081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A3,B25,B88,C25
`Chr1:57875188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:57877828`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A10,B105,B114,B119,B129,B29,B47,B59,B70,B87,C17,C30,C33,C64,C65,C66,C74
`Chr1:57877863`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr1:57877863`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr1:57877920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779658.1

212 aa

106

212

Rer1

PF03248 Rer1 23-182 aa

XP_057779663.1

199 aa

100

199

Rer1

PF03248 Rer1 23-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779658.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	23	182	8.6e-73	244.4	Rer1 family
`XP_057779663.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	23	184	1.8e-74	249.8	Rer1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923675.1
TTTAGAATGTGTTTCAGTCAGTTTTAACCGTTGAAAAAGAAGAAGATCAATCCGAATTGCGAAATTGCACAGGAAAAGGCGTTTACCGTTTTCCCTCGTCAGTATTGATTAATTCTCTGTTTAAATCTGACTAATTCATATATAGCCGAAAAGAGAAGAAAAAGAATTCAAAAATGAATACCGGCGGCGGAGCTGGCGTTGCCGACGAGTACACGAGCACCTCCTCCTTCATGCAACTAAGCCACGAGGCGTGGCGGCGC...

XM_057923680.1
TTTAGAATGTGTTTCAGTCAGTTTTAACCGTTGAAAAAGAAGAAGATCAATCCGAATTGCGAAATTGCACAGGAAAAGGCGTTTACCGTTTTCCCTCGTCAGTATTGATTAATTCTCTGTTTAAATCTGACTAATTCATATATAGCCGAAAAGAGAAGAAAAAGAATTCAAAAATGAATACCGGCGGCGGAGCTGGCGTTGCCGACGAGTACACGAGCACCTCCTCCTTCATGCAACTAAGCCACGAGGCGTGGCGGCGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998241
ATGAATACCGGCGGCGGAGCTGGCGTTGCCGACGAGTACACGAGCACCTCCTCCTTCATGCAACTAAGCCACGAGGCGTGGCGGCGCTACCAGCATCTCCTCGACAAATCGACGCCGCTGGTGCTGTACCGGTGGATCTTCCTGGCGGCGATCGCGGGGGTATACGCGCTGCGCGTCTACTTGGTTCAGGGGTTCTACATCATCACTTACGGCCTAGGAATCTATATCCTGCAGCTGCTGATCGCATTCCTGTCGCCGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779658.1
MNTGGGAGVADEYTSTSSFMQLSHEAWRRYQHLLDKSTPLVLYRWIFLAAIAGVYALRVYLVQGFYIITYGLGIYILQLLIAFLSPQVDPEIQGLTDGPALPTRGSEEFRPFVRRLPEFKFWHSLIKAFCVALLLTFFSVFDVPVFWPILLFYWSALFFLTMRRQIMHMIKYKYVPFTFGKQVCPHSIHCYKLLPKPFFLVLTFQLPPMLNF

XP_057779663.1
MNTGGGAGVADEYTSTSSFMQLSHEAWRRYQHLLDKSTPLVLYRWIFLAAIAGVYALRVYLVQGFYIITYGLGIYILQLLIAFLSPQVDPEIQGLTDGPALPTRGSEEFRPFVRRLPEFKFWHSLIKAFCVALLLTFFSVFDVPVFWPILLFYWSALFFLTMRRQIMHMIKYKYVPFTFGKQRYGKKAAPTDETNTGRP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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