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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003952`

染色体: Chr01 坐标: 57896875-57898038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003952`
名称	SmilChr01G003952
描述	uncharacterized SmilChr01G003952
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57896875 - 57898038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010599`
GeneID	`131010599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010599`
原始查询	`SmilChr01G003952`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=25.4; qcov=1.03; evalue=2.02e-18; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.4; qcov=0.558; evalue=2.17e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794182.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794182.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057794182.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794182.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57896879`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr1:57896879`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr1:57896885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B120
`Chr1:57896948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B132,B41
`Chr1:57896965`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B43,B60,B62,B78,B79,B9,C16
`Chr1:57896967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:57896999`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	7	B43,B60,B62,B78,B79,B9,C16
`Chr1:57897001`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B43,B60,B62,B78,B79,B9,C16
`Chr1:57897031`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A23,B1,B101,B103,B11,B112,B114,B118,B120,B121,B13,B134,B136,B137,B14,B27,B29,B3,B37,B38,B42,B47,B50,B51,B57,B63,B64,B67,B74,B77,B85,B87,B96,C17,C2,C24,C25,C28,C29,C32,C35,C37,C39,C4,C40,C42,C46,C52,C54,C56,C59,C64,C65,C71,C75,C76,C77,C8,C80,C83,C87,D11,D5,D8,D9
`Chr1:57897034`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B4,B88,C23,C60,D10,D11,D8
`Chr1:57897036`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A19,B110,B13,B42,B43,B60,C2,C32,C68,D6
`Chr1:57897037`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B43,B60,B79,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794182.1

346 aa

173

346

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 150-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794182.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	150	244	3.4e-11	44.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938199.1
ATGGGATTTCGGAATCTGGATTGGTTTAACTGTGCTCTTGTGGCAAAGTGGCTTTGGAGATATCTTCAGGGGGGCGAGGAGCTGTGGATTAGGGTGGTGAGATCTATCTACGGGGATGTTGAATGGGGAGAAAATGGGCTGATGTGTAAGGGAGGAAGGGGGGAGGGTGGTGGCCGAAAGTTCTTGCAGTCGGGGGAAGTGTGGCCGGGAGGTGGTTCTTTGAAAATCTCTCGCGTCAGGTGGGGAATGGTAGGGATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010599
ATGGGATTTCGGAATCTGGATTGGTTTAACTGTGCTCTTGTGGCAAAGTGGCTTTGGAGATATCTTCAGGGGGGCGAGGAGCTGTGGATTAGGGTGGTGAGATCTATCTACGGGGATGTTGAATGGGGAGAAAATGGGCTGATGTGTAAGGGAGGAAGGGGGGAGGGTGGTGGCCGAAAGTTCTTGCAGTCGGGGGAAGTGTGGCCGGGAGGTGGTTCTTTGAAAATCTCTCGCGTCAGGTGGGGAATGGTAGGGATACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794182.1
MGFRNLDWFNCALVAKWLWRYLQGGEELWIRVVRSIYGDVEWGENGLMCKGGRGEGGGRKFLQSGEVWPGGGSLKISRVRWGMVGIRSSGLIESGRWENGRWLWELKWRRELFEWEKGLLDDLISVISDGAPRAGMSDEWKWKATKSAKFTTNSAYHVIAASRGDSHSNQLPHEVLAKVWDAPTPHKVKVTAWRCLRNRLATCCNLSKRHVFLPVKEAWCNSCILREESNDHLFLSCGKSELIWDALQKWIGISTVRPKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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