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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003955`

染色体: Chr01 坐标: 57926512-57928904 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003955`
名称	SmilChr01G003955
描述	probable WRKY transcription factor 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57926512 - 57928904 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998295`
GeneID	`130998295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998295`
原始查询	`SmilChr01G003955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 7
产物	probable WRKY transcription factor 7
Arabidopsis	`AT4G24240` (WRKY7) WRKY DNA-binding protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828525] identity=50.7; qcov=1.09; evalue=7.1e-100; confidence=high
Rice	`Os04g0287400` (WRKY51) WRKY transcription factor WRKY51-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4335388] identity=42.3; qcov=1.01; evalue=1.44e-65; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY); PF10533 (Plant_zn_clust)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779712.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057779712.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057779712.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779712.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57927186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:57927236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:57927357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:57927589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:57927612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:57927753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:57927754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779712.1

328 aa

164

328

Plant_zn_clust

WRKY

PF10533 Plant_zn_clust 208-253 aa PF03106 WRKY 257-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779712.1`	Pfam	`PF10533`	Plant_zn_clust	Domain	208	253	2.4e-17	63.5	Plant zinc cluster domain
`XP_057779712.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	257	313	2.7e-27	95.5	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923729.1
TTGGAGAACAAAACAAGAATTCATTATTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCCCTTTTTTCTGAAGTCTAAAAAAAAAGAATCCCTTGTGACAGGGTAACCCTTCCTTGTACCTTTCTCCCTTCAATTTGAAAACTTACAAAAAAAGATATAAAAGCAAAATAGTATCCGGTTTCCGGTAAAGCCAGAAGATCATGGGTCCCAATCCTCAACCCCTTCAGATGGACTTTTGTATTTAAAGCTGTTAAAAGGTCAACTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998295
ATGGCAGTAGAGTTGATGCCGGGCTACAATTTCACGTCGAAGATGGAAGTGAGCGCAGCCCAGGAAGCGGCGGCGGCCGGTCTTCAGAGCGTGGAGAAGCTGATGAGATTACTCTCTCACCAACAAAATTTCCAAGAAATCCAGGCCGCCGACGATTATAAGGCTGTGGCCGATGTCGCCGTCTACAAATTCAAGAAATTCATCTCTCTACTCGACCGGACTCCGCGGACCGGCCACGCTCGGTTCCGCCGCGGACCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779712.1
MAVELMPGYNFTSKMEVSAAQEAAAAGLQSVEKLMRLLSHQQNFQEIQAADDYKAVADVAVYKFKKFISLLDRTPRTGHARFRRGPVPNSPPPPQKTEPAGPSAQTPKTEESAPGSIIYCPTPIQRLPPLPVPHNHQQQVKNVPNPIERKESSTTINFASPATSFMSSLTGDTDSLQPSMSMSSGFQITNLSQVSSAGRPPLSTSSFKRKCSSMDDATAKCGSGSSRCHCPKKRKSRLKRVVRVPAISMKMADIPPDDYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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